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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】Materiasl-Studio中怎样计算原子间的距离分布（distance distribution)
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congmingbing

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Materiasl-Studio中怎样计算原子间的距离分布（distance distribution)

用什么模块可以分析出两原子间distance distribution.
谢谢！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:02 ]
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1楼 2008-09-05 08:32:33
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玫瑰蜜

金虫 (小有名气)
Discover模块可以
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2楼2008-09-05 08:37:33
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congmingbing

木虫 (正式写手)
我在Tutorial中看到了，但是自己没鼓捣明白，对于晶体中的原子键长也能用Discover分析吗, Discover中的Analyze按钮总是处于未激活状态,不知道该怎么操作,是否需要先做什么计算呢,能否详细指点一下,非常感谢
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3楼2008-09-05 09:23:35
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玫瑰蜜

金虫 (小有名气)
采用Discover分析键长或两个原子距离变化的时候，需要在Measure中选择Distance，然后选择两个原子，界面上就会出现这两个原子之间的距离值，然后把鼠标切换到通常情况下的“箭头”状态，在该长度上单击，变色，然后再在Edit菜单下就可以定义此Set了，完成后可以在Analyst中计算长度变化情况。
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4楼2008-09-05 16:46:05
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congmingbing

木虫 (正式写手)
非常感谢指点. 在分析时选定一个set后,任务开始执行,但很快提示出错. The job has failed.不知道是什么原因.
另外analyze后得到的是什么信息呢,我想得到整个晶体的一个unit cell中键长的分布情况,就是不同的键长所占比例的情况(根据键的数目). 不知道能不能给出?

[ Last edited by congmingbing on 2008-9-5 at 17:53 ]
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5楼2008-09-05 17:41:07
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玫瑰蜜

金虫 (小有名气)
这个可能不能直接给出，你只能先统计键总数目并把不同类型的键分类，然后手动分别去分析不同类型键的键长的变化。MS的分析结果指的是某一长度在动力学过程中长度的变化情况。
其实也可以考虑用径向分布函数来研究一下。

[ Last edited by 玫瑰蜜 on 2008-9-5 at 18:03 ]
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6楼2008-09-05 18:01:32
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congmingbing

木虫 (正式写手)
谢谢指点！
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7楼2008-09-06 08:55:27
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