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lkyelf

新虫 (初入文坛)

[求助] 计算某种离子液体与丁醇、水的相互作用，得到离子液体对这两种物质的选择性 已有1人参与

各位MS的大神们好，本人初学MS与分子模拟，我想要计算某种离子液体与丁醇、水的相互作用，得到离子液体对这两种物质的选择性应该怎么算？之前我是通过对离子液体、水、丁醇分子建模并用fotcite模块对它们分别进行结构优化，先分别用forcite模块的Energy计算三个各自的能量（力场是选择的COMPASS II），再把离子液体与水，离子液体与丁醇放在一起，计算他们的总能量，那么，相互作用能=总能量-离子液体能量-水（或丁醇）的能量，这样的做法对吗？我在计算水分子单独能量的时候，计算结果是0，这样对吗？哪里出了问题？或者还有什么其他的方法可以得到离子液体对这两种物质的选择性？
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1楼 2015-10-09 11:31:51
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992648352

银虫 (小有名气)
这样简单的算分子间相互作用，不考虑真实条件(温度，溶剂等)能行吗？两分子的相互作用能代表宏观性质吗？
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3楼2015-10-14 08:57:23
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我认为应该计算不同分子间的相互作用来计算体系的总能量吧!你的这个体系总共三种粒子对应的有六种作用。软件我不懂，但是按你说的道理似乎不太对吧？你再考虑一下!不管怎么样，你做的j就是个三元共混体系嘛?共混方面的文好多，自己找个看一下！
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2楼2015-10-09 16:44:54
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lkyelf

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 992648352 at 2015-10-14 08:57:23
这样简单的算分子间相互作用，不考虑真实条件(温度，溶剂等)能行吗？两分子的相互作用能代表宏观性质吗？

你好，你提的意见很对，我们只是想从几十种离子液体中用这个理论计算的方法挑选出一两种对丁醇选择性较好的离子液体来进行实验，避免实验工作量过大，并不是做比较专业的分子模拟。溶剂方面确实没有考虑，因为我们做渗透汽化实验的话过的是气体，温度的话再计算能量的时候有输入温度的。我这个是之前参加一个MS培训班的时候跟老师提问他给我说的预方案，我计算下来也觉得不太对，或者你有没有什么较好的意见呢？
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4楼2015-10-15 19:16:54
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lkyelf

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-10-09 16:44:54
我认为应该计算不同分子间的相互作用来计算体系的总能量吧!你的这个体系总共三种粒子对应的有六种作用。软件我不懂，但是按你说的道理似乎不太对吧？你再考虑一下!不管怎么样，你做的j就是个三元共混体系嘛?共混方面 ...

我做的丁醇跟水分离是渗透汽化过程，丁醇分子与水分子在接触离子液体的时候是气态的，所以我只考虑离子液体跟丁醇与水的作用，这样应该不需要考虑三元共混吧？
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5楼2015-10-15 19:19:42
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