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lzp19900213

金虫 (小有名气)

[交流] 1900bp 的模板，目标产物1000bp, 竟然p出了3500左右的条带，求解释。

1900bp 的模板，目标产物1000bp, 竟然p出了3500左右的条带，求解释。

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1楼 2015-10-02 10:48:29
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xiudie

至尊木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同意2楼观点，最大可能是模板二聚化，查找模板自身是否存在相同或相似序列，及不同位置的反向互补后与原有序列存在相似区域，这些都可以导致二聚化。另外的可能模板不存或有外源污染，这个可对你的3000多的序列测一个反应看看是不是1900里面的序列
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4楼2015-10-02 11:18:16
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976592787

木虫 (正式写手)

国家自然科学基金委员会委员长
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-10-02 11:18:26
用质粒p的吧，可能没p出来，如果1900处也有带，3500那条就是模板质粒二聚化形式。如果仅在3500有一条亮带，那还有种可能就是marker有问题

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耻与众草之为伍，何亭亭而独芳！何不为人之所赏兮，深山穷谷委严霜。
2楼2015-10-02 11:00:18
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lzp19900213

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 976592787 at 2015-10-02 11:00:18
用质粒p的吧，可能没p出来，如果1900处也有带，3500那条就是模板质粒二聚化形式。如果仅在3500有一条亮带，那还有种可能就是marker有问题

cDNA p的。

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3楼2015-10-02 11:04:27
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lzp19900213

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiudie at 2015-10-02 11:18:16
同意2楼观点，最大可能是模板二聚化，查找模板自身是否存在相同或相似序列，及不同位置的反向互补后与原有序列存在相似区域，这些都可以导致二聚化。另外的可能模板不存或有外源污染，这个可对你的3000多的序列测一 ...

好的，谢谢！

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5楼2015-10-02 16:13:19
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