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fengyuyaoye0708

新虫 (初入文坛)

[交流] 有人会用Block maker和Codehope设计兼并引物吗?

各位虫友:
      你们好!现在我已经被推到风口浪尖了,设计简并引物后用基因组DNA扩增后一直没有结果,现在要用Block maker和Codehope设计简并引物重新进行扩增,不知哪位虫友会在线使用,我自己捣鼓了好长时间也不知道怎么应用的,请各位虫友一定要帮忙!
      明年快毕业了,但是实验一直不顺,现在已经支撑不下去了!着急得到各位的帮助!
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csdyg

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
codehop我用过,开始也是一头雾水,慢慢就用顺了,可以讨论一下
5楼2009-08-29 22:26:57
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

Codehope
1,点BLOCK MARKER,进入新页面
2,在SINGLE FORMAT用fasta输入3遍序列,之后点MAKE BLOCKS
3,在获得的页面中将内容复制下,拷贝到首页的PASTE YOUR BLOCK BELOW中
4,在下面的CODON USAGE TABLE中选最近的物种名
5,往下点LOOK FOR PRIMERS
6,如果PRIMERS不够长,点后面的链接,在新的界面中黏贴上不够长的PRIMERS,可以计算前半部分大写字母的Tm值
7,可在不够长的PRIMERS前自己添加碱基序列
2楼2008-09-03 20:46:52
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fengyuyaoye0708

新虫 (初入文坛)

太感谢你了

今天一直看有人留言没有
想不到真看到了
真心感谢你
3楼2008-09-03 22:12:06
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yuyixst

木虫 (正式写手)

记得自己一直用primer5.0和oligo6.0去做这些简并引物..
4楼2008-09-04 11:32:15
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