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903654640

木虫 (正式写手)

[求助] AOB功能基因DGGE条带回收后用不带GC夹引物扩增条带位置大小不对 已有1人参与

我做的是水处理中氨氧化细菌的功能基因amoA用的引物是通用的amoA-1F/2R,做DGGE的引物是GC-amoA-1F/amoA2R DGGE 效果跑的还可以,就是DGGE条带切下来之后拿水溶解完之后,把水溶解产物用于PCR扩增的模板,用不带GC夹的引物对去扩增,我的片段是490bp,但是扩增出来的位置却大小不一,marker 是DL2000 请问各位大侠们这是什么原因啊?

AOB功能基因DGGE条带回收后用不带GC夹引物扩增条带位置大小不对
2015-09-20 17hr 13mindgge条带回收验证.jpg
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wubingqi

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
903654640: 金币+5, ★有帮助 2015-10-04 08:01:54
正常,DGGE上你看着是一条带,实际上可能有好几条没有分开,建议别用DGGE了,现在高通量也比较便宜了。
2楼2015-09-29 09:51:46
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李秀玲0819

新虫 (初入文坛)

请问你AOB PCR的条件是什么
我本将心邀明月,奈何明月照沟渠
3楼2016-05-03 12:37:43
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