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克拉克肯特至尊木虫 (著名写手)
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In order to identify the members of the IMMs in L. maculans, the Hidden Markov Model (HMM) profiles unique to cyclophilin (accession no. PF00160) and FKBP (accession no. PF00254) from Pfam database (version 26.0) (https://pfam.sanger.ac.uk/) were retrieved and then searched against the genome browser database of L. maculans (https://urgi.versailles.inra.fr/) using HMMER 3.0 software (https://hmmer.janelia.org/). 完全不理解他做了什么。。。。。求解释 |
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baoshanqiu
至尊木虫 (著名写手)
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【答案】应助回帖
| 为了找出L. maculans中的IMMs成员，从Pfam 数据库(26.0版本)(https://pfam.sanger.ac.uk/)提取了亲环蛋白独特的隐马尔可夫模型(HMM) 谱（登记号PF00160）和FKBP （登记号PF00254），然后用HMMER 3.0软件(https://hmmer.janelia.org/)查询L. maculans (https://urgi.versailles.inra.fr/)基因组浏览器数据库。 |
2楼2015-09-28 23:07:46
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为了确定十字花科小球腔的IMMS各成员，从Pfam数据库（版本26.0）（http：//pfam.sanger.ac.uk/）检索亲环素（登录号PF00160）和FKBP（登录号PF00254）的独特Hidden Markov Model（HMM）档案，并用HMMER3.0软件（https://hmmer.janelia.org/）对十字花科小球腔的基因组浏览器数据库（https://urgi.versailles.inra.fr/）进行搜索。 解释： 此过程的目的：确定十字花科小球腔的IMMS各成员，应该主要包括cyclophilin (accession no. PF00160) 和FKBP (accession no. PF00254)。为了拿到这两个成员的情况，先在Pfam数据库中找到这两个成员的基本档案（基本信息），最后根据相关信息在十字花科小球腔的基因组浏览器数据库中搜索得到所要的东西。 |
3楼2015-09-29 04:27:05
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