24小时热门版块排行榜

当前主题已经存档。

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教蛋白superimpose并计算rmsd值的问题

有人知道如果我想先superimpose两个蛋白的整体部分，但不需要给出整体的rmsd，只是再选择给出其中某一段的rmsd值，并且可以处理swap现象，有哪类软件可以处理这样的情况呢？

谢谢啦

[ Last edited by zzgyb on 2008-9-2 at 11:46 ]

1楼 2008-09-02 10:46:42

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

木虫 (著名写手)

★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢

从来都是用vmd里的基本rmsd程序，再自己写tcl脚本，什么情况都可以处理

3楼2008-09-18 00:02:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

木虫 (正式写手)

★ ★
gromacs(金币+2,VIP+0):Thanks for your suggestion

insightII里有这个功能, 可以选择蛋白的任意部分分别对应计算,也可以计算骨架原子,重原子,或者全原子等都可以

…spendmoretimewithyourfamilyandfriends……eatyourfavoritefoods……visittheplacesyoulove…

2楼2008-09-09 10:23:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖