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银虫 (初入文坛)

[求助] 基因芯片通路选择

实验室去年做了基因芯片实验,目的是为了了解Clas侵染柑橘转录组变化,明确抗感病机制,筛选抗病基因,但是拿到数据分析思路一直不明。现在用的分析软件为agrigo,但是每个样品及时间段富集到通路不是很一致,自己想要的条目往往是一级条目下面,筛选基因工作量大。本人对于这个项目是个新手,想问下,这个病害互作一般大家关注那些GO Term,哪些通路及相关基因需要重点查找?不慎感激!
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iamddmm

新虫 (初入文坛)

这个需要大量的背景知识,你得多看相关文献,理清楚现有的调控途径,然后预测出你觉得有意思的部分基因和路径,再结合你的芯片实验数据,进行验证。否则那么多数据,你怎么看?
2楼2016-01-08 20:37:33
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