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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 有两个菌株MB10，F4基因序列已知，请问用什么方法能鉴定到种属？
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shuhuahenu

银虫 (初入文坛)

[求助] 有两个菌株MB10，F4基因序列已知，请问用什么方法能鉴定到种属？ 已有4人参与

送去生物公司鉴定了，相似度达到0.992的有好几个，老师想让再比对一下，尽量确定，我对这一窍不通。。。求助

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月光下我的身影有时很远有时很近
1楼 2015-09-18 11:51:57
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草溪河

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
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2楼2015-09-18 12:16:47
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blaundy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做系统发育树以及生理生化实验结合伯杰氏细菌手册来鉴定来鉴定
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3楼2015-09-18 14:46:31
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shuhuahenu

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 草溪河 at 2015-09-18 12:16:47
在NCBI网站上进行Blasta比对，就可以初步判定其种属。详细的比对方法建议在百度里面搜索，网上有很多教程。

多谢了！我试试

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月光下我的身影有时很远有时很近
4楼2015-09-18 15:55:21
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
加测个看家基因，应该就可以了！

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5楼2015-09-18 19:50:21
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shuhuahenu

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2015-09-18 19:50:21
加测个看家基因，应该就可以了！

怎么加测？再送去检测公司吗

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月光下我的身影有时很远有时很近
6楼2015-09-19 08:35:15
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by shuhuahenu at 2015-09-19 08:35:15
怎么加测？再送去检测公司吗
...

类似于16S，再扩一个看家基因，然后测序。你得是什么属？

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7楼2015-09-19 15:28:09
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xiaojunwsw

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
16S 扩增 ，然后去Blast 或韩国Ezbiocloud比对即可
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8楼2015-09-20 00:26:48
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