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wmwman306

禁虫 (著名写手)

[交流] EST序列怎么上传?[有效期至9月1日晚6点]

我做了差异显示方面的实验,得到一些EST序列,用sequin上传交给GeneBank,总是出问题,是不是有EST序列提交的专门软件。
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yurui0211

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
wmwman306(金币+4,VIP+0):谢谢! 2-20 14:21
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取。
NCBI的GenBank提供了两个投递方式:
1、在线投递-BankIt,特点是比较方便。
2、本地投递文件生成程序——Sequin。目前NCBI seqin有MAC, PC和UNIX不同版本。其输出文件需要你通过电子邮件发给NCBI.
另外,上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况。如果大规模的测序如EST、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径。
另外,提醒你的两个问题:
1、对你所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解,这通常是出错的地方(seqin)
2、在你投递序列到发表文章之间,要注意NCBI发给你的电子邮件,它会询问你在什么时间将序列公布。

参考资料:NCBI Submission http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html
临渊羡鱼,不如退而结网!
2楼2008-08-29 16:16:22
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pliu6682

木虫 (正式写手)


wmwman306(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-20 14:22
楼上说的就够用了
3楼2008-08-29 16:18:30
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wmwman306

禁虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yurui0211 at 2008-8-29 16:16:
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取。
NCBI的GenBank提供了两个投递方式:
1、在线投递-BankIt,特点是比较方便。
2、本地投递文件生成程序— ...

请问一下“如果大规模的测序如EST、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径。
”中的“专门的投递途径”指的是?
4楼2008-08-29 17:27:05
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