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HPLC2008

木虫 (正式写手)

[求助] 计算ECD出错,求高手指点! 已有3人参与

本人菜鸟,想用gaussian 09计算ECD帮助确定构型结果出错,求指点
input
*****************************************
%chk=/home/zjc/input/3622.chk
%nprocshared=8
Will use up to    8 processors via shared memory.
%mem=5000MB
-------------------------------------------------------------
#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm
-------------------------------------------------------------

错误:
rnie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.
======================================================================================================
                                       Pseudopotential Parameters
======================================================================================================
  Center     Atomic      Valence      Angular      Power
  Number     Number     Electrons     Momentum     of R      Exponent        Coefficient   SO-Coeffient
======================================================================================================
EOF while reading ECP pointer card.
Error termination via Lnk1e in /home/zjc/g09/l301.exe at Mon Sep 14 20:33:37 2015.
错误2:


======================================================================================================
                                       Pseudopotential Parameters
======================================================================================================
  Center     Atomic      Valence      Angular      Power
  Number     Number     Electrons     Momentum     of R      Exponent        Coefficient   SO-Coeffient
======================================================================================================
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A FLOATING POINT NUMBER AS INPUT.
  1 2 1.0 6 1.0 60 1.0 67 1.0                                                   
  ?
Error termination via Lnk1e in /home/zjc/g09/l301.exe at Mon Sep 14 20:25:41 2015
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

不是方法,就是输入文件的问题

发自小木虫Android客户端
7楼2015-09-17 06:21:09
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普通回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
HPLC2008: 金币+4, 有帮助, 能讲清楚点吗? 2015-09-15 11:06:49
你的输入文件有问题,再仔细看看
它要整型数据,你给了个实型

发自小木虫Android客户端
2楼2015-09-15 06:25:59
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HPLC2008

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2015-09-15 06:25:59
你的输入文件有问题,再仔细看看
它要整型数据,你给了个实型

能不能讲清楚点,意思是我的结构给的有问题吗
3楼2015-09-15 11:07:17
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by HPLC2008 at 2015-09-15 11:07:17
能不能讲清楚点,意思是我的结构给的有问题吗...

要看完整的输入文件才能看出错在哪里
4楼2015-09-15 13:31:14
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wbfeng721

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
HPLC2008: 金币+4, 有帮助, 谢谢 2015-09-16 22:11:56
赝势的写法出错,好好读说明书

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2015-09-15 20:09:04
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HPLC2008

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by qchem at 2015-09-15 13:31:14
要看完整的输入文件才能看出错在哪里...

我用来优化,又可以计算,就是用"#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm"计算ECD,就不行,是不是我计算ECD的方法出了问题呀
6楼2015-09-16 22:16:09
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小范范1989

木虫 (著名写手)

你把你的输入文件贴出来,因为提示就是你的赝势机组有问题,应该是你输入文件最后没有定义。你把你完整的输入文件贴出来。
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
8楼2015-09-17 06:47:21
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HPLC2008

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-09-17 06:47:21
你把你的输入文件贴出来,因为提示就是你的赝势机组有问题,应该是你输入文件最后没有定义。你把你完整的输入文件贴出来。

好,主要我在外面,电脑上没有带着输入文件,要在计算的电脑上才有,谢谢
9楼2015-09-18 22:13:30
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HPLC2008

木虫 (正式写手)

%chk=/home/zjc/input/3622.chk
%nprocshared=8
%mem=5000MB

#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm

3622

0 1
C                  3.94931600   -0.20724400    1.47431200
C                  4.31607500   -0.22708400   -0.02837800
C                  3.12823100   -0.48461000   -1.00379500
C                  2.15921200   -1.53835700   -0.39901200
C                  1.89024200   -1.35143300    1.10482100
O                  3.11747300   -1.29917700    1.83628000
O                  0.94588000   -1.51712500   -1.10960500
C                  0.01822300   -2.56674400   -0.75561700
C                 -0.18773900   -2.70358200    0.76313700
C                  1.05646900   -2.51359800    1.62584600
C                 -1.36144200   -2.09454800   -1.26963800
C                 -2.10276700   -1.63763400    0.03333200
O                 -1.14970800   -1.67900600    1.08249000
O                  5.28672100   -1.24871600   -0.24272100
O                  2.82751600   -2.79347900   -0.52620600
C                  3.49218600    1.16462700    1.98794700
N                 -2.65976500   -0.30143900   -0.02145300
C                 -4.00259100    0.02320500   -0.03960600
C                 -4.03904500    1.42043300   -0.07411800
N                 -2.75872400    1.95104900   -0.06575800
C                 -1.97302100    0.89910900   -0.03484600
N                 -5.05642600   -0.80571300   -0.02537200
C                 -6.20846100   -0.12735800   -0.04414300
N                 -6.40311200    1.20083000   -0.07884800
C                 -5.32226100    2.00849700   -0.09728300
O                  2.32319710    1.54403789    1.46378365
O                  4.08938940    1.76773694    2.85864911
C                  1.78736195    2.78947110    1.95683896
N                 -5.51010400    3.34922700   -0.17462500
H                  4.89495900   -0.39051500    1.99847500
H                  4.79062800    0.71941700   -0.29355800
H                  1.34550800   -0.41565100    1.22254600
H                  0.34266700   -3.50390300   -1.21478700
H                 -0.63234400   -3.68818000    0.96732300
H                  0.75479700   -2.33104700    2.66212000
H                  1.64983300   -3.43181700    1.60347300
H                 -2.95056300   -2.30238000    0.23313600
H                  4.82834200   -2.09448000   -0.07922100
H                  2.93306800   -2.98234000   -1.47593500
H                 -0.89216200    0.93001500    0.00147400
H                 -7.11482800   -0.72976700   -0.02815400
H                  0.82847471    2.91145647    1.45454847
H                  2.45947641    3.61237353    1.70491155
H                  1.65190100    2.74285755    3.03970264
H                 -4.73291000    3.96119800    0.03119000
H                 -6.43746900    3.70481200    0.01435000
O                 -2.09909100   -3.01045900   -2.05235100
C                 -2.33241300   -4.30893300   -1.51255100
H                 -2.93410100   -4.83753400   -2.25474100
H                 -1.39951300   -4.86577000   -1.35720400
H                 -2.89147400   -4.28040200   -0.56843300
H                 -1.20630100   -1.23680400   -1.92713300
O                  3.72922401   -1.09962007   -2.14636667
C                  4.82819353   -0.30217533   -2.59497327
O                  5.03605889    0.83152178   -2.08990553
C                  5.76051845   -0.83260080   -3.69997059
C                  6.94402408    0.02618584   -4.18308539
H                  7.59180827   -0.34235653   -4.95084326
C                  7.19840477    1.41357740   -3.56499550
H                  8.06486233    1.85116844   -4.01517922
H                  6.35021228    2.04233252   -3.73859417
H                  7.35688466    1.31119770   -2.51176119
C                  5.51339981   -2.21886535   -4.32351127
H                  5.41680471   -2.12058915   -5.38460088
H                  6.33750365   -2.86318157   -4.09854577
H                  4.61419180   -2.63600875   -3.92062625
H                  2.64747893    0.43220648   -1.27439615

1 2 1.0 6 1.0 16 1.0 30 1.0
2 3 1.0 14 1.0 31 1.0
3 4 1.0 53 1.0 67 1.0
4 5 1.0 7 1.0 15 1.0
5 6 1.0 10 1.0 32 1.0
6
7 8 1.0
8 9 1.0 11 1.0 33 1.0
9 10 1.0 13 1.0 34 1.0
10 35 1.0 36 1.0
11 12 1.0 47 1.0 52 1.0
12 13 1.0 17 1.0 37 1.0
13
14 38 1.0
15 39 1.0
16 26 1.0 27 2.0
17 18 1.0 21 1.0
18 19 2.0 22 1.0
19 20 1.0 25 1.0
20 21 2.0
21 40 1.0
22 23 2.0
23 24 1.0 41 1.0
24 25 2.0
25 29 1.0
26 28 1.0
27
28 42 1.0 43 1.0 44 1.0
29 45 1.0 46 1.0
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47 48 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49
50
51
52
53 54 1.0
54 55 2.0 56 1.0
55
56 57 2.0 63 1.0
57 58 1.0 59 1.0
58
59 60 1.0 61 1.0 62 1.0
60
61
62
63 64 1.0 65 1.0 66 1.0
64
65
66
67
10楼2015-09-22 08:57:12
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