| 查看: 558 | 回复: 0 | ||
[求助]
求助，靶向分子动力学模拟始态和终态原子数不同可以做么？
|
| 我做的课题是用靶向分子动力学研究蛋白质的构象变化，始态终态两个体系是一个蛋白的向内张开与向外张开构象与细胞膜膜的复合体系，所用的软件是NAMD。由于两个体系的空间大小并不相同，所以在除去与蛋白重叠的部分popc膜时除去的原子数也不同，之后添加的水分子数也不同，最后两个体系的原子数有了一定的差距；再往下进行靶向分子动力学的时候总是报错两个体系的原子数不同，我研究的对象只是蛋白质分子，剩下的popc膜和水分子都不是研究重点，有没有办法能在当前体系下只对蛋白进行靶向分子动力学模拟，望大神赐教。 |
回复此楼» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
