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liaup

木虫 (小有名气)

[交流] 求助:RT_PCR中的问题

做的是从细胞上清中提取病毒RNA,然后rt-pcr.现在的问题是阳性(病毒液提取的rna)对照可以扩增出目的条带,可是样本却扩不出来,是不是样本中病毒RNA的含量低,或者PCR的体系不适合,怎样去验证可能的原因呢?请高手指教啊!

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-12 at 09:24 ]
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

==b
我的意思是上清里头的病毒RNA
把实验拆开很多步,设置质检的关卡,一查就知道哪里出错了
3楼2008-08-27 16:25:01
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):积极交流奖
抽完病毒RNA测下OD或者跑下胶看看到底有没有抽出来或者浓度如何再说吧~~
2楼2008-08-27 16:24:19
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赵敏9565

铁虫 (小有名气)


xyklmu(金币+1,VIP+0):积极交流奖
1.增加PCR循环,2.加大模板量3.减少阳性对照模板用量

如果还是阳性对照有,样本没有,是否可以说你样本中检测不到病毒核酸!
5楼2008-08-27 20:44:56
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liaup

木虫 (小有名气)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):积极交流奖
多谢你们!!!
每次提完RNA都测了OD值,样本的A260/280一般为1.4-2.0。 RNA浓度为0.7-2.0μg/ml
其中阳性对照样本A260/280为1.73. RNA浓度为1.6μg/ml.
   PCR时循环数为31个,模板的用量样本我在50μl体系中加入5μl都试过,仍然没有结果,阳性对照我加3μl做过,可以p出目的条带。另外我将没有p出条带样本的PCR产物分别稀释25,50倍,作为模板再进行PCR,结果仍然没有p出条带
   现在都做了接近40份样本了,连一份阳性的都没有,40份中一份都没有似乎不太可能吧。还是真的样本没有病毒的RNA(或者很低很低)。
  不知道怎么判断, 请多多指教!
6楼2008-08-28 11:51:56
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