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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 测序已知lncRNA位置，如何知道序列？
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linglanyuyi

新虫 (初入文坛)

[求助] 测序已知lncRNA位置，如何知道序列？ 已有2人参与

跟公司做了lncRNA测序，奈何分析时间早就过了，公司不给序列，求助各位大神指点迷津。如何在已知lncRNA位置的情况下，查询序列？
lincRNA:chr1:134867906-134885481_f
跪求大神赐教！
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1楼 2015-09-08 15:46:17
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weiyf11

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
UCSC网站上可以做这个事情，有序列文件可以下载
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2楼2015-09-08 16:58:18
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BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼上说的对，UCSC Genome Browser或许能给你点帮助，最好你还知道基因组版本信息（所用的参考基因组不一样序列会有点差异，人最新的是hg38，也有用hg19的）。
你这条序列17k，应该还要有外显子信息吧。做lincRNA研究呢，还是找个懂生物信息的合作为好！！！
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3楼2015-09-15 22:59:55
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