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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 有关转录因子的查找
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liyibo373

金虫 (小有名气)

[求助] 有关转录因子的查找 已有2人参与

本人非生物科班出身，问的问题可能有些不着边，但还是希望各位高手指点一下。

1：转录因子有多少，每一种基因的转录都需要转录因子的辅助吗

2：转录因子可以调控特定基因的转录，我能不能查到调节一种酶（比如说酚氧化酶）转录的转录因子呢，说白点：
转录因子——基因转录——翻译——蛋白（酶），我怎么查到下游酶是否有相关转录因子呢。好吧，我也晕了，是老板这样让我查的。
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互相交流，互相学习，共同进步
1楼 2015-09-06 15:49:23
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liyibo373: 金币+2, ★有帮助, 谢谢回复 2015-09-06 16:27:44
如果是生物信息学分析就算了，那个不靠谱，一般用酵母单杂筛出来的

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2楼2015-09-06 16:06:59
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liyibo373

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Neo2000 at 2015-09-06 16:06:59
如果是生物信息学分析就算了，那个不靠谱，一般用酵母单杂筛出来的

谢谢，我再问一下，比如说这几种常见的酶：全脂酶，乙酰胆碱酯酶，谷胱甘肽-S-转移酶，保护酶等，我怎么查出这些酶相关的转录因子呢
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3楼2015-09-06 16:27:28
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
liyibo373: 金币+1 2015-09-06 17:25:44
引用回帖:
3楼: Originally posted by liyibo373 at 2015-09-06 16:27:28
谢谢，我再问一下，比如说这几种常见的酶：全脂酶，乙酰胆碱酯酶，谷胱甘肽-S-转移酶，保护酶等，我怎么查出这些酶相关的转录因子呢...

你得先查找上游启动子

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4楼2015-09-06 17:03:50
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liyibo373

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Neo2000 at 2015-09-06 17:03:50
你得先查找上游启动子
...

那启动子怎么查啊，是先查到基因吗，NCBI 里有吗
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5楼2015-09-06 17:26:46
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
liyibo373: 金币+2, ★有帮助 2015-09-06 18:20:59
引用回帖:
5楼: Originally posted by liyibo373 at 2015-09-06 17:26:46
那启动子怎么查啊，是先查到基因吗，NCBI 里有吗...

你做哪个物种，模式生物可以查询基因组数据库

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6楼2015-09-06 17:33:04
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liyibo373

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Neo2000 at 2015-09-06 17:33:04
你做哪个物种，模式生物可以查询基因组数据库
...

不是，是蝗虫（东亚飞蝗）
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7楼2015-09-06 18:20:47
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evangelina

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-09-06 22:59:59
liyibo373: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-09-07 10:30:52
转录因子有很多种的，还有许多是未知的。每一个基因的转录都需转录因子的。事实上，基因转录的调控很大程度上是通过细胞对其特有的一组转录因子的活性进行调控。

如果要查一个酶的转录因子，最直接的办法是先看看有没有直接研究这个问题的文献。如果没有，再从功能上看这个酶属于哪一类生理反应的。例如，炎症反应相关的酶，很多都会被NF-kB这个转录因子调控。实在是没找到的话，就跟楼上说的，要从这个基因的启动子着手。定位启动子序列以后，可以用某些软件看看有没有已知转录因子的consensus sequence。最后，通过实验手段，可以做所谓的Ch-IP，把目标基因的启动子跟和它作用的转录因子免疫沉淀，然后通过质谱或其它方法去确定。
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8楼2015-09-06 20:13:14
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liyibo373

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by evangelina at 2015-09-06 20:13:14
转录因子有很多种的，还有许多是未知的。每一个基因的转录都需转录因子的。事实上，基因转录的调控很大程度上是通过细胞对其特有的一组转录因子的活性进行调控。

如果要查一个酶的转录因子，最直接的办法是先看看 ...

谢谢回答！我再查查
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9楼2015-09-07 10:41:12
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