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hxppxh木虫 (正式写手)
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[求助]
求软件做RNA-Seq 数据的GO 富集分析 已有2人参与
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rna-seq数据，物种为非模式生物，有未注释的基因组序列。 已经进行了如下分析：6万多个基因用blastx比对了nr数据库，用得到的xml文件做了mapping GO term。现在想做 GO enrichment analysis. 我知道blast2go可以做，可是把比对nr的结果上传到blast2go后，map GO term 超级慢，可blast2go好像不能用其它软件的map GOterm的结果。看了一下R packages的说明书，还是不知道怎么做。 请有经验的虫友指点一下，谢谢！ |
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8楼2016-12-13 14:24:09
bioplant
木虫 (正式写手)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 11276.5
- 红花: 3
- 帖子: 454
- 在线: 114小时
- 虫号: 115908
- 注册: 2005-11-24
- 性别: MM
- 专业: 植物生理与生化
5楼2015-09-11 06:41:06
baichi121234
禁虫 (职业作家)
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本帖内容被屏蔽 |
6楼2015-09-11 07:50:26
9楼2019-01-08 09:01:31
10