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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 引物设计的时候怎么在DNA的同一条链上设计.
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杜鹃羽

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-09-03 23:03:22
没用过PP，我用的是oligo7，引物设计的是后上游引物是与所用dna链（A链）相同的序列，也就说是与另一条DNA链（B链）互补用来合成A链的，下游引物是从A链末端向前与A链互补的，用来合成B链的。合成酶只能从5'向3’合成，引物是有方向的，如果你的引物都与一条链互补，那应该是你就设计错了……
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11楼2015-09-02 20:03:19
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ARE KIDDING ME ? 引物设计软件默认互补 多看看书 孩子
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生命不息奋斗不止
12楼2015-09-03 13:32:33
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ssy7166

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不用那么辛苦了，直接找公司设计就好，又便宜又快速。
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13楼2015-09-03 15:25:15
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清华池大学

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一句话，DNA互补配对的双螺旋结构！

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扬帆起航
14楼2015-09-03 15:49:06
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胡啊胡

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-03 23:03:43
提交的设计引物的序列是5-3，那么显示出的反向引物就是和提交序列配对的。而正向引物配对的序列已经是提交序列的互补序列，即3-5了，你仔细看下就能发下序列已经互补过来了～

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15楼2015-09-03 20:06:37
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Huobol

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
上游引物扩增得到的单链与你的输入序列一致，即双链中上面那条，也就是编码链，与起始密码子ATG方向相同；下游引物扩增得到的单链与你的输入序列反向互补，即双链中下面那条，也就是模板链。当然你输入的只是部分序列的话就谈不上编码链或是模板链了，除非已经知道研究的是编码序列了。软件设计得到的就是扩增双链的，图中的两条链，上面的那条蓝色代表编码链，即你的输入序列，红色代表模板链，即你的反向互补序列，所以当你点击S你会发现图中有一小段蓝色序列即上游引物序列与一条红色的反向互补序列配对，扩增得到你的输入序列对吧，当你点击AS，你会发现图中有一小段红色序列即下游引物序列与一条蓝色的即正向即你的输入序列配对，扩增得到反向互补序列对吧。希望我说的颜色没有错，我记得上面是蓝色下面是红色。

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弱者退散
让羽毛再飞一会儿
16楼2015-09-04 11:25:12
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Huobol

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by Huobol at 2015-09-04 11:25:12
上游引物扩增得到的单链与你的输入序列一致，即双链中上面那条，也就是编码链，与起始密码子ATG方向相同；下游引物扩增得到的单链与你的输入序列反向互补，即双链中下面那条，也就是模板链。当然你输入的只是部分序 ...

唉 说的这么详细，也不回个话，伤心啊。

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让羽毛再飞一会儿
17楼2015-09-05 12:43:36
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园园许

新虫 (初入文坛)
只能解释，你分子生物学的基础还没有理解
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高兴是一天，苦恼也是一天，何以？
18楼2015-09-05 16:36:17
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弱者退散

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by Huobol at 2015-09-05 12:43:36
唉 说的这么详细，也不回个话，伤心啊。
...

哦我懂了十分感谢
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19楼2015-09-06 11:16:32
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弱者退散

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
16楼: Originally posted by Huobol at 2015-09-04 11:25:12
上游引物扩增得到的单链与你的输入序列一致，即双链中上面那条，也就是编码链，与起始密码子ATG方向相同；下游引物扩增得到的单链与你的输入序列反向互补，即双链中下面那条，也就是模板链。当然你输入的只是部分序 ...

懂啦非常感谢
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20楼2015-09-06 11:22:54
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