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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 环境 » 交流探讨 » 怎样从16S rDNA测试的18个原始数据压缩包中找出特定的6个数据进行单独分析
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柏伽索斯

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样从16S rDNA测试的18个原始数据压缩包中找出特定的6个数据进行单独分析 已有1人参与

做测试的时候，总共是送到某测试公司18个样品，对方给的分析鉴定报告是把18个样品的结果化成一个进化树了。其实这18个样品是两个不同的项目的，有6个是需要单独分析的。现在想从原始数据的压缩包里面把特定的6个样品的数据找出来，单独分析，画进化树。压缩包的文件格式有sff,fasta,qual。怎么着出相应的数据进行分析啊？有大牛能帮忙解答一下吗？谢谢！
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1楼 2015-08-30 19:26:29
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柏伽索斯

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 南大微生物 at 2015-08-30 21:59:37
那你单独把那6个样品的原始数据分析好了

首先感谢回复！这是我第一次发帖求助！谢谢！
还想问一下，直接用MEGA就可以分析吗？复杂吗？6个样品每一个单独画一个进化树，6个样品再画一个总的进化树，得需要多久？对电脑硬件有要求吗？谢谢！如果问的太简单了，不要见笑！嘿嘿，我是第一次分析这类数据！
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3楼2015-08-31 17:41:01
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南大微生物

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
柏伽索斯(gaofeng925代发): 金币+1, 积极交流 2015-08-31 08:08:18
柏伽索斯: 金币+2, ★有帮助, 第一次发帖的回复！感谢！ 2015-08-31 17:41:55
那你单独把那6个样品的原始数据分析好了
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2楼2015-08-30 21:59:37
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南大微生物

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 柏伽索斯 at 2015-08-31 17:41:01
首先感谢回复！这是我第一次发帖求助！谢谢！
还想问一下，直接用MEGA就可以分析吗？复杂吗？6个样品每一个单独画一个进化树，6个样品再画一个总的进化树，得需要多久？对电脑硬件有要求吗？谢谢！如果问的太简单 ...

这个新手肯定需要花很长的时间，而且会画的不标准，出现各种问题 ，数据分析肯定需要培训的，如果是会的，那就很简单，也很方便！
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4楼2015-08-31 17:56:37
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