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迷途小书童

木虫 (小有名气)

[交流] 如何计算小分子化合物与高聚物之间的相互作用力?

我是一名在读硕士生,由于课题中碰到一些问题,需要用MS做一个模拟的实验,由于本身不是材料专业,对这个软件一无所知,所以希望小木虫的兄弟姐妹们可以给小弟提供帮助。

简单的说,我需要考察的是一个染料分子与一种无定形高聚物之间的相互作用力(染色过程模拟)。但是具体的软件界面上的操作方法我不了解,所以我希望虫友们可以为我提供帮助,写一下具体的软件操作步骤和方法,不胜感激,30金币奉上。
参考的外文原文这里贴不上,有兴趣的同学可以留下邮箱联系,或加我QQ,我给你传阅原文(不明白为什么原文改成文本也不能发...Orz)
我的QQ是527359767

[ Last edited by 迷途小书童 on 2008-8-23 at 19:59 ]
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迷途小书童

木虫 (小有名气)

没有兄弟做过类似的模拟吗?
2楼2008-09-03 07:33:56
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迷途小书童

木虫 (小有名气)

难道就没有人知道么?
3楼2008-09-22 14:04:36
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asaruda

铁虫 (初入文坛)

能给我看看么? 邮箱my_201@sina.com
新手上路,多多指教!!
4楼2008-09-22 14:45:12
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小老鼠151

铁杆木虫 (正式写手)

我会做这方面相关的模拟

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
灯塔守望者(金币+2,VIP+0):感谢小木虫上的热心朋友
迷途小书童(金币+5,VIP+0):回答奖励
你这个是模拟小分子在聚合物中扩散、吸附计算,用分子动力学就可以计算,要用到 material Visualizer、discover模块和Amorphous Cell模块、Compass力场才能计算,不知道你们实验买了这些模块了吗?我们实验室刚好有这些模块,我也是做这方面计算的。如果你需要这方面的资料可以跟我联系,我的QQ是278479924
IfindthattheharderIworkthemoreluckIseemtohave.
5楼2008-09-26 12:29:05
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wobuzhidao1

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
迷途小书童(金币+2,VIP+0):已经给你发了
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
把英文文章发给我看看,jdmren@163.com。根据楼上的说法,我考虑了一下,染色过程和扩散过程好像还不太一样,应该是界面的吸附过程吧,看看文章我给你回复吧
6楼2008-09-28 12:39:03
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zczc6

银虫 (小有名气)

可用blends模块试试

★ ★ ★ ★ ★
迷途小书童(金币+3,VIP+0):说的似乎简单了点,呵呵
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
用blends可计算flory-hugins参数χ,以作为相容性判据。
7楼2008-09-29 15:12:40
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wobuzhidao1

金虫 (小有名气)

文章看过了,给你一些回复吧

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
迷途小书童(金币+10,VIP+0):这里的“ms用户指南中discover模块下的吸附例子”具体是指哪本参考上的例子?
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
上网不方便,今天看了文章,
文章中,文章作者通过构件PLA无定型模型后,通过在模型上面放置10A的真空层后,将dye分子放置在表面,通过MD后来计算吸附能,通过对照其他实验,判断吸附趋势,你想重复这种模拟,可以通过参照学习ms用户指南中discover模块下的吸附例子就明白了。
第二篇文章通过构建不同组分含量的无定形的混合物,(具体水解好像是手动将末端的功能基团改为水解后的?)你可以采用MS软件的Amorphous模块构建模型,而后采用discover模块进行MD运算,从而计算吸附能。
不知道理解的对不对,多指教
8楼2008-10-06 19:27:57
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keyan0043

荣誉版主 (职业作家)

一介草虫!

优秀版主优秀版主

楼主把文章发给我一份吧,我先看看,大家再交流!linghuchong1976@163.com

[ Last edited by keyan0043 on 2008-10-9 at 16:34 ]
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚!
9楼2008-10-07 10:53:50
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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)

搂住 吧文章发给我看看啊 我的是高分子扩散问题啊
xjxj1234xjxj@163.com
一起随缘
10楼2008-10-07 20:09:08
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