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汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2021  |  回复: 3

shanxw

铁虫 (小有名气)

[求助] siRNA干扰蛋白和mRNA抑制率计算 已有1人参与

实验设计化学合成了siRNA采用lipo2000进行细胞转染后,提取细胞蛋白和RNA进行western blot和qpcr实验,看到相关文献上有提到蛋白和mRNA抑制率的问题,不知应该怎么计算,求指导!
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evangelina

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shanxw: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-08-31 09:31:39
如果是western blot,就用image J 定量knockdown和control的条带的亮度,然后以control为百分之百去看knockdown的减少了多少。要有内参证明两边总量差不多。

如果是mRNA层面就用qPCR测出同等量的总mRNA里面,knockdown组的目标基因跟control比减少了多少。当然这个你也需要内参。
2楼2015-08-28 20:59:19
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shanxw

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-28 20:59:19
如果是western blot,就用image J 定量knockdown和control的条带的亮度,然后以control为百分之百去看knockdown的减少了多少。要有内参证明两边总量差不多。

如果是mRNA层面就用qPCR测出同等量的总mRNA里面,kno ...

非常感谢!
3楼2015-08-31 09:31:45
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xiaomili1206

新虫 (初入文坛)

我也想问这个问题,我是用英格恩的R4000转染的,也想问同样的问题
4楼2015-09-06 10:26:56
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