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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » siRNA干扰蛋白和mRNA抑制率计算
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shanxw

铁虫 (小有名气)

[求助] siRNA干扰蛋白和mRNA抑制率计算 已有1人参与

实验设计化学合成了siRNA采用lipo2000进行细胞转染后，提取细胞蛋白和RNA进行western blot和qpcr实验，看到相关文献上有提到蛋白和mRNA抑制率的问题，不知应该怎么计算，求指导！
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1楼 2015-08-28 19:20:57
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evangelina

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shanxw: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-08-31 09:31:39
如果是western blot，就用image J 定量knockdown和control的条带的亮度，然后以control为百分之百去看knockdown的减少了多少。要有内参证明两边总量差不多。

如果是mRNA层面就用qPCR测出同等量的总mRNA里面，knockdown组的目标基因跟control比减少了多少。当然这个你也需要内参。
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2楼2015-08-28 20:59:19
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shanxw

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-28 20:59:19
如果是western blot，就用image J 定量knockdown和control的条带的亮度，然后以control为百分之百去看knockdown的减少了多少。要有内参证明两边总量差不多。

如果是mRNA层面就用qPCR测出同等量的总mRNA里面，kno ...

非常感谢！
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3楼2015-08-31 09:31:45
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xiaomili1206

新虫 (初入文坛)
我也想问这个问题，我是用英格恩的R4000转染的，也想问同样的问题
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4楼2015-09-06 10:26:56
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