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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 对蛋白MS/MS后的结果进行分析
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gzhnsf

[交流] 对蛋白MS/MS后的结果进行分析

请教各位如何对蛋白MS/MS后的结果进行分析,如何确定鉴定结果是否可信.

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-12 at 09:12 ]
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1楼 2008-08-22 18:57:41
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qfzhang

银虫 (小有名气)
★
gzhnsf(金币+1,VIP+0):谢谢
1 结果可靠性由方法决定，一个方法的精密度和重复性如何，试验之前应该有大体的估计。
2 相信结果可靠的前提下，结果只有两种情况，符合预期和不符合预期。
3 对符合预期的很好办，对不符合自己预期的，就要分析原因了。从样品制备是否成功，到过程中的各个步骤对目标蛋白或分子的影响。例如，样品制备的过程中，各种修饰成分有无变化，有没有二聚体，或者各个亚基分开的不彻底。
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2楼2008-08-23 10:55:48
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gzhnsf

如果说所得分数不怎么高的话怎办,结果还可不可靠?
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3楼2008-08-27 13:16:36
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yf0906yf

木虫 (小有名气)
★
gzhnsf(金币+1,VIP+0):谢谢
1.确定检索参数的设定是否合适
2.BLAST看看是哪个地方出了问题，质谱无法区分I和L
3.看是否发生了修饰

尽可能的得到高分，祝你好运
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4楼2008-09-04 12:41:38
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lengshan1977

★
gzhnsf(金币+1,VIP+0):谢谢
专业蛋白质组刊物对串联质谱数据都有很严格的要求，你可以到MCP或者JPR的author information里面找找看
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5楼2008-09-04 17:17:43
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