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jjyy188

木虫 (小有名气)

[求助] 请教下菌种鉴定的问题 已有2人参与

请教下?菌种长时间保存后复苏,如何鉴定没有改变或突变,是否就用分子生物学方法测全基因组序列吗?还是用其它什么方法?混沌中,请指教?
请各位指点,谢谢!
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csyhaoge

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
关于菌种鉴定问题,可以从以下几个方面进行考虑:
1、形态结构
每种菌,其都有各自独特的形态结构,可以观察单菌落的形态(显微镜及肉眼观察),通过比较该单菌落与目的菌单菌落的外在特征进行判断
2、生理生化特性
通过查找目的菌特有的生理生化特性,比较现有菌,即可进行判断。
3、16sRNA的基因组测序
如上述方法不能或不易进行判断的话,可以考虑对菌株的16sRNA的基因序列进行测序,这个很简单,而且花费很低,将测序回来的序列与数据库中 数据进行比对,就是我们通常说的建立个系统进化发育树,即可精确的判断菌株是否发生改变。除非要求极高,建议楼主还是不需要对菌株进行全基因组测序了吧,毕竟那个花费,呵呵,还是偏高且是不需要的~
希望能对你有所帮助~
2楼2015-08-27 01:41:47
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flightty

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主,复苏后菌种是否有发生突变,采用目前的分子生物学方法难以鉴定,否则菌种改造就非常好做了。16sRNA只能鉴定到种属,也就是说只要你的菌种没变,不管退化还是变异,鉴定出来都一样。否者只能通过外观或理化性质加以鉴定。
3楼2015-08-27 07:52:38
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