24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 4344  |  回复: 1

pigg9

铁虫 (初入文坛)

[求助] 高GC含量DNA序列测序应注意哪些因素

小弟最近在做几个高GC含量DNA的cloning,今天刚刚完成全部的cloning,并跑了带确认长度没问题。于是,就开始准备测序了。不过小弟以前并没有做过高GC含量DNA的测序,不清楚要注意哪些因素(比方说primer改怎么设计,PCR时要注意哪些等等之类的),才能保证序列能够被读出的同时,亦能保证其可信性(准确率)。因为我们实验室,我是第一个开始做高GC含量DNA的cloning,周围能够请教的人不多。还请各位大神走过路过帮帮小弟一下,万分感激。

四个高GC含量DNA片段的长度都在1600 bp 到1770 bp。而这四个片段的GC含量分别是,45% (这个其实不算高),62%, 75%,78%。我们实验室测序PCR用的酶是applied biosystems 的Big Dye.看了官网的说明书未发现关于高GC含量DNA做测序时的注意事项(也可能是我眼花了)。

还请各位拨冗指点小弟。

谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

烨火赤心

铜虫 (小有名气)

楼主,现在问题解决了么?有没有什么改进的措施?
2楼2019-05-10 15:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pigg9 的主题更新
信息提示
请填处理意见