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snp中连锁不平衡问题计算
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刚踏入生物信息学，看到连锁不平衡资料但是不清楚几个问题 1.D’和r2公式的解释 ︱D′︳＝D2／min(fAfb, fafB) (D＜0) ︱D′︳＝D2／min(fAfB, fafb) (D＞0) r 2＝D2／fAfafBfb 2.D’的值与连锁的关系，以及与最多有几个单体型分别是什么，就是看不懂以下知识点？ D’＝1称为完全LD , 说明两个位点间没有发生重组； 两位点组成的单体型最多出现3种。 D’＝0称为无LD或连锁平衡, 即4种单倍型频率相等。 D’＜1说明两位点间发生过重组或突变； 4种单倍型均可出现；D’相对值意义模糊。 D ’接近1：提示：两位点间发生重组的可能性很小； D ’中间值：无法比较两位点LD 的差别。 D’值的95%可信区间(confidence inteeval,CI） 进行比较。 最好是有个例子，谢谢大牛们。小女感激不尽 |
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