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小猫的日月

铜虫 (初入文坛)

[交流] 半定量PCR数据求统计分析方法

各位大神，我的PCR做完了，但是不知道数据怎么分析，因为我做的是三种样本，其中两个是患者的病变部位组织和他本人没有病变部位组织，这两个是配对的，例数是一样的；第三个是其他正常人的正常对照组织，例数和患者的例数是不一样的。做完PCR后，我分别用三个副孔的Ct值求平均后再计算△Ct值，然后用患者病变部位的△Ct值减去没有病变部位的△Ct值，是等于△△Ct，再求-△△Ct，之后用2^-△△Ct，求出Fold change。其中，△Ct病变组合△Ct没有病变组可以用统计方法计算两者的关系，fold change 是用来做图的？是这样的吗？然后我想问下，我三个样本用什么方法进行统计分析，先是三组样本之间进行比较，再两两进行比较？现在很疑惑，谢谢！
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1楼 2015-08-21 09:32:37
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dingnana

禁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
2楼2016-05-25 21:15:56
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czbd2016

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
虽然荧光定量PCR和半定量RT-PCR都可以用来检测基因的表达量的,但二者检测的东西多少有些不同.荧光定量PCR是在PCR反应体系中加入可以和双链DNA特异性结合的荧光染料或者和目的DNA片段结合的荧光探针，通过监控PCR过程中荧光的变化,并且和某些管家基因的荧光变化进行对比反应出目标基因的表达量.我们所用的BIOG荧光定量PCR法的主要有效数据是荧光信号增长到最大值的一半时的时间.半定量RT-PCR则是通过RT-PCR最终产物电泳后电泳条带的明暗来间接反应出原始模板的丰度.我觉得楼主可以换荧光定量PCR试试
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3楼2019-03-27 09:03:36
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