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小猫的日月

铜虫 (初入文坛)

[交流] 半定量PCR数据求统计分析方法

各位大神,我的PCR做完了,但是不知道数据怎么分析,因为我做的是三种样本,其中两个是患者的病变部位组织和他本人没有病变部位组织,这两个是配对的,例数是一样的;第三个是其他正常人的正常对照组织,例数和患者的例数是不一样的。做完PCR后,我分别用三个副孔的Ct值求平均后再计算△Ct值,然后用患者病变部位的△Ct值减去没有病变部位的△Ct值,是等于△△Ct,再求-△△Ct,之后用2^-△△Ct,求出Fold change。其中,△Ct病变组合△Ct没有病变组可以用统计方法计算两者的关系,fold change 是用来做图的?是这样的吗?然后我想问下,我三个样本用什么方法进行统计分析,先是三组样本之间进行比较,再两两进行比较?现在很疑惑,谢谢!
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dingnana

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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2楼2016-05-25 21:15:56
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czbd2016

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
虽然荧光定量PCR和半定量RT-PCR都可以用来检测基因的表达量的,但二者检测的东西多少有些不同.荧光定量PCR是在PCR反应体系中加入可以和双链DNA特异性结合的荧光染料或者和目的DNA片段结合的荧光探针,通过监控PCR过程中荧光的变化,并且和某些管家基因的荧光变化进行对比反应出目标基因的表达量.我们所用的BIOG荧光定量PCR法的主要有效数据是荧光信号增长到最大值的一半时的时间.半定量RT-PCR则是通过RT-PCR最终产物电泳后电泳条带的明暗来间接反应出原始模板的丰度.我觉得楼主可以换荧光定量PCR试试
3楼2019-03-27 09:03:36
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