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落木风声

金虫 (正式写手)

[求助] 引物设计 已有1人参与

请问各位前辈，设计引物的时候，从NCBI上下载的序列比对后要不要两端切齐，然后再按照切齐后的序列设计引物啊？
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
1楼 2015-08-19 20:55:03
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人车

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
落木风声: 金币+5 2015-08-20 13:17:07
切齐应该是没必要吧  你可以从你需要的那段开始设计就可以了
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2楼2015-08-20 09:06:52
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 人车 at 2015-08-20 09:06:52
切齐应该是没必要吧  你可以从你需要的那段开始设计就可以了

好的，谢谢
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
3楼2015-08-20 13:16:47
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河畔佳人

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
4楼2015-09-09 08:54:17
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 河畔佳人 at 2015-09-09 08:54:17
引物设计怎么设计？我用primer设计的话，是直接找一个近似种的基因序列进行设计还是用多物种基因序列的比对结果序列来作为模板进行设计？

看看能不能在网上找到你要的物种的序列，找不到的话，就多找几个近似种的序列试试
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
5楼2015-09-09 10:20:53
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河畔佳人

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
6楼2015-09-09 15:34:43
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 河畔佳人 at 2015-09-09 15:34:43
能再详细一点吗？我的意思是，假如我要设计这个基因的引物，但是这个基因在我要研究的昆虫中没有人做出基因序列来，我要自己设计引物，把这个基因的序列克隆出来。就卡在引物设计阶段了。我不明白的是，设计引物所 ...

个人觉得找几条近似种的序列比对寻找保守序列，或者查找文献看看有没有人做过你所要研究对象的近似种的实验，有的话，可以用那文献上的引物试试
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
7楼2015-09-09 21:18:57
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