24小时热门版块排行榜    

查看: 793  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 mengsk 的 2 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】MS找过度态,消虚频

请问大家是如何用MS找过度态的?计算完成.castep文件说“transition state found”,但却有3个大虚频,应如何消去两个虚频呢?CASTEP只能根据反应物和产物的结构找过渡态吧?这相当于Gaussian中的QST2。是不是应该修改反应路径的参数?我一开始用coarse精度,提高精度能不能行?
回复此楼
奋斗中的小木虫
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

对反应物和产物进行了初步优化,精度为coarse;
3个虚频对应的波数分别是-677、-135、-64。
我做的是一个水分子与一边的氧断裂氢键,与另一边的氧形成氢键的情形:
O------H—O—H------O
-135是反应方向上的振动,-64也大致在反应方向上但多了H2O中的O在垂直反应方向上的振动,-667是H2O自身的对称弯曲振动且垂直与反应方向。
奋斗中的小木虫
3楼2008-08-20 10:45:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

zhmj

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
mengsk(金币+3,VIP+0):谢谢!请问如何能消掉虚频?
你的反应物和产物进行优化了么?
你的三个虚频到底相差多少?
看一下三个虚频对应的振动模式是否正确
2楼2008-08-19 22:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

请简单解释一下声子频率(phonon frequencies)和声子散射光谱(phonon dispersion spectrum)吧?与红外振动有什么联系吗?俺是化学专业的,对这些概念比较比较陌生。谢谢!
奋斗中的小木虫
4楼2008-08-20 11:16:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingchiyu

银虫 (小有名气)

楼主你好!我遇到了同样的 问题,可以分享你解决的办法吗?
5楼2008-09-08 12:36:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
信息提示
请填处理意见