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落木风声

金虫 (正式写手)

[求助] 引物设计 已有3人参与

请问，这怎么看的，哪一个是正确配对效率，哪些是错误的

引物设计
360反馈意见截图16370629436762.png
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
1楼 2015-08-18 20:12:01
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-19 23:19:27
438的是正确配对效率  表示如果有1000条引物的话 那么有438条可以正确配对
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生命不息奋斗不止
2楼2015-08-19 12:30:07
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 冷雁孤旅 at 2015-08-19 12:30:07
438的是正确配对效率  表示如果有1000条引物的话 那么有438条可以正确配对

那怎么有上下两个部分（红色字体的positive strand和蓝色字体的negative strand）是什么意思？
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
3楼2015-08-19 20:51:50
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lijianfu12

银虫 (正式写手)
内容已删除
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好好搞学术
4楼2015-08-19 22:27:16
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人车

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 落木风声 at 2015-08-19 20:51:50
那怎么有上下两个部分（红色字体的positive strand和蓝色字体的negative strand）是什么意思？...

你说的那两个是可能是正向引物和反向引物吧
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5楼2015-08-20 09:06:04
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vege的桌子

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个是用Oligo做出来的分析结果，红色字体的positive strand和蓝色字体的negative strand分别代表正链和负链，上下两个结果是表示引物跟正链和负链上面的碱基序列的配对结果。
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6楼2015-08-20 12:05:29
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lijianfu12 at 2015-08-19 22:27:16
这是什么软件？

oligo6
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
7楼2015-08-20 13:12:47
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 人车 at 2015-08-20 09:06:04
你说的那两个是可能是正向引物和反向引物吧...

都是正向的
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
8楼2015-08-20 13:13:10
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落木风声

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by vege的桌子 at 2015-08-20 12:05:29
这个是用Oligo做出来的分析结果，红色字体的positive strand和蓝色字体的negative strand分别代表正链和负链，上下两个结果是表示引物跟正链和负链上面的碱基序列的配对结果。

谢谢，那我们主要是看正链的还是负链的
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这世上一定存在着某些美好值得我们为之奋战到底
9楼2015-08-20 13:15:58
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