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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 在Multiwfn四处攻城略地的情况下,我可以宣布NLO Calculator接近寿终正寝了 已有8人参与

  我记得sob说过一句话,大概意思是“由于Multiwfn不断发展,已经让几十个波函数分析程序失去了存在的价值”。
  终于有一天,我也可以宣布NLO Calculator寿终正寝了。
  严格来讲,非线性光学计算,不算波函数分析,但是它跟波函数有千丝万缕的联系。我想也正是这个原因,让sob豪气万分地扫荡了这一区域吧。
  前几天我试用了Multiwfn中的NLO计算部分,发现这部分功能已经涵盖了NLO Calculator至少一半儿的功能了。
  还没涵盖的功能之一是“Harmonic light intensity as a function of the polarization angle Ψ by polar representation”(可见JPCA, 2012, 116, 10249的Fig. 5)但是这个很简单的,就是几个小公式而已。
  功能之二是“非线性光学材料的阻尼震荡”(Multiwfn计算的是无阻尼震荡),这个其实也蛮简单的,因为计算公式也已经被我们推导来出了,并发表了。
  之三是“the Movie of Periodic vibration of electron density distribution driven by an external electromagnetic field with the electric field”,这个其实还是简单的,就是在外加电场条件下进行电子云密度偏转的计算,然后连接成gif动画而已。
  之二之三,都可以见ChemPhysChem 2015, 16, 1889,至于gif动画可见该文章的Supporting Information

  如果sob神再把上述这几个功能加上,我觉得NLO Calculator就真的可以彻底寿终正寝了。

  其实NLO Calculation的编写,纯属偶然。我爱人还在读博士生的时候,新接触了一个领域,共轭分子体系的二阶非线性光学效应的理论模拟。她啃了一堆文献。
  这一行儿三个方法,SOS方法,CPHF或CPDFT方法,FF方法。其中FF方法我们嫌太糙,就嫌弃它,不用它。而且国内有一个重要的实验兼理论的课题组也一直用FF方法进行模拟,我们也不想跟人家撞车抢饭碗。更重要的是FF方法无法加入动态超极化率的计算,这是很严重的缺点。
  至于SOS呢,我们用不起。我们当时要研究的体系太大了,而SOS方法需要考虑上百个激发态才有准确性。SOS(zindo)计算太不准确了,SOS(CIS)计算量可以接受但是在大多数情况下也不够准,而SOS(TD-DFT)计算上百个states我们有点承受不起。
  最后我们选了CP-DFT(CAM-B3LYP或LC-BLYP)。
  说是“我们选了”,其实是我爱人选了。她负责idea,我去实现这个程序。我爱人就是这个程序的第一位用户。连名字都是她起的。她说:“这个计算器还挺好用的,挺快捷”。于是我就直接命名为Calculator了。即将发布的时候,我又加了个缩写词NLO,变成了NLO Calculator(非线性光学计算器)。第一个发布版本叫v 0.2
  后来我继续研究其他领域去了,对NLO的关注度就变小了。后来别人在使用NLO Calculator的时候给出一些bug报告,我便稍稍改动它,于是便有了v 0.21,v 0.22。此时,它还仍旧是一个无阻尼震荡程序。再后来,有个本科毕设的好娃娃,完成了CP-DFT的震荡公式中加入阻尼系数的推导和coding,我便改动版本号为v 0.23。这几年课题组对NLO材料进行了许多实验研究和某些理论研究。有时候需要用到它了就拿来用一用。用不到它的时候也实在想不起它。
  这个故事好平淡啊,毕竟我这几年也根本没在它身上投入什么精力。浑浑噩噩地让它小范围流传了,我也没关心。这几天要提交一个基金申请书,我突然想起,我要不要看看NLO Calculator被引用了多少次啦?没想到居然也有了十几次了。无心插柳,居然也有人关注。其实这本是我为了方便我爱人的研究而做的一个小程序,而事实上我爱人(L. Zhang)也只用过它一次,后来她也转到别的领域去了。现在看到被T. Zhang呀C.-G. Liu呀J. Wang呀S. Chen呀X. Zhang呀H.-Q. Wu呀L. Zhao呀C. Chen呀C. Wang等人用起来了,我居然有点默默感谢他们的感觉。其实这里面有俩人儿,我认得他们的名字,因为他们以前用邮件给我报告过bug的。这里还应该提及我的师兄Y. Zhang。他的在国外做博后时期,做的一项工作对我们影响重大(Y. Zhang, B. Champagne, J. Phys. Chem. C, 2012, 116, 21973),第二项工作对我们影响较大(Y. Zhang, B. Champagne, J. Phys. Chem. C, 2013, 117, 1833),第三项工作有一定影响(Y. Zhang, F. Castet, B. Champagne, Chem. Phys. Lett. 2013, 574, 42)。

  不过这都快成为历史了吧。前几天我试用了Multiwfn中的NLO计算部分,感觉Multiwfn已经几乎让NLO Calculator失去存在的价值了。如果再加上上述三条功能,它真的就没有存在的必要了。
  其实我以前从来没想过说这些。现在觉得它要进坟墓啦,就想随便说说而已,说不清是欣喜还是悲伤,或者两者兼而有之,但貌似第三种情绪,也就是敬佩,更多些吧。Multiwfn功能如此繁多,让我十分佩服。以后世界上不会再有NLO Calculator的存在价值了。立此为悼,亦怀欣喜。
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

三年来引用了NLO Calculator的文章们

==== Research Papers ====
(15) Superalkali atoms bonding to the phenalenyl radical: structures, intermolecular interaction and nonlinear optical properties. S. Chen, H.-L. Xu, S.-L. Sun, L. Zhao, Z.-M. Su, J. Mol. Model. 2015, 21, 209. (DOI: 10.1007/s00894-015-2750-x)
(14) Nature of the Intense Second-Order Nonlinear Optical Activity: DFT Studies on the Octupolarization of Sandwich-Type Bis(phthalocyaninato) Yttrium Skeletons. D. Qi, J. Jiang, ChemPhysChem 2015, 16, 1889. (DOI: 10.1002/cphc.201500082)
(13) Carborane tuning on iridium complexes: redox-switchable second-order NLO responses. J. Wang, W.-Y. Wang, X.-Y. Fang, Y.-Q. Qiu, J. Mol. Mod. 2015, 21, 95. (DOI: 10.1007/s00894-015-2650-0)
(12) Theoretical exploration to the cation effect on the second-order nonlinear optical properties of Strandberg-type polyoxometalates. T. Zhang, W. Guan, S. Wen, T. Ma, L. Yan, Z. Su, J. Theor. Comput. Chem. 2015, 14, 1550007. (DOI: 10.1142/S0219633615500078)
(11) Modulating the Charge Transfer of D−S−A Molecules: Structures and NLO Properties. X. Zhang, H.-Q. Wu, H.-L. Xu, S.-L. Sun, Z.-M. Su, J. Phys. Chem. A 2015, 119, 767. (DOI: 10.1021/jp5103127)
(10) Nature of second-order nonlinear optical response in phthalocyanine derivatives: a density functional theory study. C. Wang, C. Chen, Q. Zhang, D. Qi, J. Jiang, Turk. J. Chem. 2014, 38, 1046. (DOI: 10.3906/kim-1406-39)
(9) Density functional theory study of pure octupolar porphyrazines with second-order nonlinear optical activity. L. Zhao, C. Chen, Z. Li, D. Qi, J. Jiang, J. Porphyrins & Phthalocyanines 2014, 18, 715. (DOI: 10.1142/S1088424614500539)
(8) Li doped effect of through novel noncovalent charge transfer on nonlinear optical properties. H.-Q. Wu, H.-L. Xu, S.-L. Sun, Z.-M. Su, Dyes & Pig. 2014, 106, 7. (DOI: 10.1016/j.dyepig.2014.01.031)
(7) Theoretical exploration on switchable NLO response induced by photochromic properties of covalently connected unsymmetrical spiropyran–polyoxometalate complex. T. Zhang, N. Ma, L. Yan, T. Ma, Z. Su, Dyes & Pig. 2014, 106, 105. (DOI: 10.1016/j.dyepig.2014.03.007)
(6) Density functional theory prediction for the second-order nonlinear optical responses of phenanthroline-fused phthalocyanine derivatives. C. Chen, L. Zhang, L. Zhao, D. Qi, J. Jiang, J. Porphyrins & Phthalocyanines 2014, 18, 56. (DOI: 10.1142/S1088424613500855)
(5) Computational study on redox-switchable second-order nonlinear optical properties of ferrocene-tetrathiafulvalene hybrid. C.-G. Liu, M.-L. Gao, Z.-J. Wu, RSC Adv. 2014, 4, 38300. (DOI: 10.1039/C4RA04548C)
(4) Computational Study on Redox-Switchable Second-Order Nonlinear Optical Properties of Totally Inorganic Keggin-Type Polyoxometalate Complexes. C.-G. Liu, X.-H. Guan, J. Phys. Chem. C 2013, 117, 7776. (DOI: 10.1021/jp400185a)
(3) Density Functional Theory Study on Subtriazaporphyrin Derivatives: Dipolar/Octupolar Contribution to the Second-Order Nonlinear Optical Activity. L. Zhang, D. Qi, L. Zhao, C. Chen, Y. Bian, W. Li, J. Phys. Chem. A 2012, 116, 10249. (DOI: 10.1021/jp3079293) 【这是我爱人作为第一作者的文章,也是NLO Calculator第一次被使用】

==== Conference Papers ====
(2) 以双层酞菁钇配合物为八极矩骨架的二阶非线性光学响应系数的密度泛函理论研究. 齐冬冬, 姜建壮. 中国化学会第十二届全国量子化学会议论文摘要集, 2014, 中国, 太原.
(1) [Oral Presentation] Excellent Second-order Nonlinear Optical Activity Originating from Octupolarization in Sandwich-type Rare Earth Phthalocyanine Skeleton. D. Qi, J. Jiang,  The Eighth International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, 2014, Istanbul, Turkey.
2楼2015-08-17 14:00:15
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主做dye sensitizer吗?
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
3楼2015-08-17 14:45:32
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4楼2015-08-17 15:04:04
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ktkh

铁杆木虫 (知名作家)

青椒一百五十斤


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你可以和sob合作下加进去嘛...另外sob的程序没有加入betaHRS...
其实大部分做量化计算的编程序初衷就是处理数据方便,当然sob它们做的比较全面比较强大转而专门做方法和程序了,大部分其他人就是各用户.有程序方便点,没程序自己搞个excel计算稍微复杂点也能完成,再会编程序那就实现各小程序更方便点...
海阔天空
5楼2015-08-17 15:29:57
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ZJboy

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
闻者伤心,见者流泪......
6楼2015-08-17 19:44:38
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qinzhong6138

至尊木虫 (著名写手)

灰常灰常笨的小笨蛋

牛牛冬冬!
加油
7楼2015-08-17 23:16:38
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小范范1989

木虫 (著名写手)


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送红花一朵
我对yjcmwgk的印象就是热心的大神,和对sob老师的印象是一样的。
借助这些平台,各位像yjcmwgk的老师热心解决问题,包括还有好多量化的高手。而且写了好多经典的东西。这种无私奉献让人敬佩。
ps:科研就是在各位的领导下越来越强大。
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
8楼2015-08-19 10:11:27
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我爱天津

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主是高手 。。赶紧关注下

发自小木虫Android客户端
9楼2015-11-26 00:49:19
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SC20131111

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
您好,看到这个帖子感觉您应该是非线性领域的精通者,因为最近需要写篇综述,在这里想向您咨询几个问题,但是我不是学习这块领域的,谢谢!
梅花香自苦寒来
10楼2016-04-10 21:13:41
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