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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问生物信息学预测软件TargetP1.1可以用来分析原核细胞的蛋白质定位吗？
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

[求助] 请问生物信息学预测软件TargetP1.1可以用来分析原核细胞的蛋白质定位吗？ 已有1人参与

如题，软件TargetP 1.1 predicts the subcellular location of eukaryotic proteins. The location assignment is based on the predicted presence of any of the N-terminal presequences: chloroplast transit peptide (cTP), mitochondrial targeting peptide (mTP) or secretory pathway signal peptide (SP).  说明里是真核生物，但中文文献有人也用来预测细菌的，合适吗？
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1楼 2015-08-13 22:07:41
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币
另外一个亚细胞定位预测软件PSORTb----------Submit a Sequence to PSORTb version 3.0.2
Based on a study last performed in 2010, PSORTb v3.0.2 is the most precise bacterial localization prediction tool available.            这个可以预测原核细胞比如说是细菌的蛋白质定位
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上邪!我欲与君相知，长命无绝衰。山无陵，江水为竭，冬雷震震，夏雨雪，天地合，乃敢与君绝！
2楼2015-08-13 22:11:10
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)
3楼2015-08-14 10:26:16
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wuer413023: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢，就是太慢了，递交了一个蛋白质序列就运行了好长时间 2015-08-14 19:13:43
LocTree2:https://www.rostlab.org/services/loctree2/也可以预测原核生物亚细胞定位。
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4楼2015-08-14 17:55:09
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