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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » DOSCAR 中Mg的PDOS有d轨道态密度
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klwang

木虫 (著名写手)

[求助] DOSCAR 中Mg的PDOS有d轨道态密度 已有1人参与

用VASP计算含Mg和Nd的化合物，考虑自旋。
Mg的膺势不含d轨道，为什么画出来的Mg的PDOS有d轨道成分（见图）？请大侠指点。

我理解的DOSCAR的数据顺序 ，并且根据此进行的数据归总和分析。希望这个顺序没有错误。
Energy(eV)        s_1_up        s_1_dn        p_1_up        p_1_dn        p_2_up        p_2_dn        p_3_up        p_3_dn        d_1_up        d_1_dn        d_2_up        d_2_dn        d_3_up        d_3_dn        d_4_up        d_4_dn        d_5_up        d_5_dn        f_1_up        f_1_dn        f_2_up        f_2_dn        f_3_up        f_3_dn        f_4_up        f_4_dn        f_5_up        f_5_dn        f_6_up        f_6_dn        f_7_up        f_7_dn

另外，我没有用VASP的tool kits。因为有明显的bug，我自己写的PERL程序生成了原子轨道PDOS，保留了原有数据格式，然后用MATLAB把每个原子轨道PDOS按元素加起来。
PERL程序是没有问题的，我和原始数据比对过了，没有出入。对于MATLAB，我是新手，就是把文件读入矩阵，然后矩阵相加。结果就出现了很奇怪的d轨道成分在Mg的PDOS里。做法如有错误，请大侠指点。或请大侠分享分析方法和程序。

谢谢！
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  • 附件 1 : Mg-PDOS.jpg
    • 2015-08-13 12:21:44, 1.29 M

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1楼 2015-08-13 12:23:13
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
klwang(ljw4010代发): 金币+13, 代发奖励 2015-08-15 08:26:56
有种可能性，在做WS半径的时候Nd有一部分被划入Mg的球体中。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

klwang
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2015-08-14 03:25:13
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
klwang: 金币+1, ★有帮助 2015-08-14 22:59:27
你得看d轨道的成分多少。。和p轨道相比是不是算少。。。POTCAR里面只是原子的价电子，并不代表计算完之后不会有d轨道的成分，因为在和其他原子杂化的时候出现d的成分，我认为很正常。
赞一下(1人) 回复此楼
凝聚态理论与计算物理
8楼2015-08-14 22:31:18
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普通回帖

wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
klwang: 金币+5, ★有帮助, 谢谢大侠回复 2015-08-13 23:26:17
没有d，一般来说DOSCAR也会有d，但是是否有f得看你的元素。你应该把INCAR、DOSCAR的一部分贴出来看看，才好分析
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凝聚态理论与计算物理
2楼2015-08-13 12:51:15
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klwang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-08-12 16:51:15
没有d，一般来说DOSCAR也会有d，但是是否有f得看你的元素。你应该把INCAR、DOSCAR的一部分贴出来看看，才好分析

谢谢回复。
我的材料里面有Nd,含有d和f轨道，但是Mg是没有的，不知道为什么结果这么奇怪。
另外，我注意到OUTCAR里，费米面的电子数不为整数，请问大侠遇到过这种情况吗？

System =  Ba24NdO72Ta12Mg5Zr5
ISTART = 0        
ISMEAR = 0        
SIGMA = 0.05      
PREC  = Accurate  
ENCUT = 615 eV   
LREAL  = Auto     
EDIFF = 1.0E-5   
EDIFFG = -1.0E-2   
ISPIN = 2         
NBANDS = 800      
MAXMIX = 40
NPAR   = 4        
ALGO   = Normal
IBRION = 2        
NSW    = 1        
ISIF   = 3        

LORBIT = 11      
EMIN = -65        
EMAX =  80        
NEDOS = 800      

LDAU = .TRUE.  
LDAUTYPE = 2   
LDAUL = 0 3 0 0 0 0
LDAUU = 0 6 0 0 0 0
LDAUJ = 0 0 0 0 0 0
LDAUPRINT = 2     

MAGMOM = 24*0 2*3 72*0 12*0 5*0 5*0         

LCHARG  = .True.  
LWAVE  = F
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  • 附件 1 : mg_doscar.dat
    • 2015-08-13 23:23:09, 1.81 M
3楼2015-08-13 23:24:42
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
klwang: 金币+1, ★有帮助, 抱歉，您的回复不能接受。Mg的d轨道没有在POTCAR里，是不应该出现这种情况的。 2015-08-14 22:21:37
引用回帖:
3楼: Originally posted by klwang at 2015-08-13 23:24:42
谢谢回复。
我的材料里面有Nd,含有d和f轨道，但是Mg是没有的，不知道为什么结果这么奇怪。
另外，我注意到OUTCAR里，费米面的电子数不为整数，请问大侠遇到过这种情况吗？

System =  Ba24NdO72Ta12Mg5Zr5
IS ...

有d正常吧。。毕竟不是晶体，不是原子，有d的成分正常。
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凝聚态理论与计算物理
5楼2015-08-14 09:09:36
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neweroica

木虫 (著名写手)
4樓正解
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Simpler, stronger, more tolerant
6楼2015-08-14 14:15:30
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klwang

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-08-13 07:25:13
有种可能性，在做WS半径的时候Nd有一部分被划入Mg的球体中。

谢谢回复，因为您没有用应助回复，我没有办法给您金币。送上红花一朵。
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7楼2015-08-14 22:17:32
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

而且VASP用的是平面波的基，最后投影出d的成分，很正常吧。
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凝聚态理论与计算物理
9楼2015-08-14 22:41:13
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klwang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wmy8802217 at 2015-08-14 02:31:18
你得看d轨道的成分多少。。和p轨道相比是不是算少。。。POTCAR里面只是原子的价电子，并不代表计算完之后不会有d轨道的成分，因为在和其他原子杂化的时候出现d的成分，我认为很正常。

问题是我的材料是块材料，不是cluster或molecule，实验上表明是半导体或绝缘体，离子键，Mg没有d轨道参与计算，结果出现d轨道的电子态，您不觉得这种杂化不是很奇怪吗？如果Mg有d轨道参与计算，我不否认您的说法。
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10楼2015-08-14 22:59:02
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