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汕头大学海洋科学接受调剂
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fanc232

新虫 (小有名气)

[求助] 求推荐计算HOMO-LUMO gap的教程 已有2人参与

大家好，我是学生物的，现在研究药物小分子-蛋白质大分子之间相互作用。
查文献说计算HOMO-LUMO之间的gap，可以帮助预测药物分子-蛋白质作用强度。
因此在这里求大家给推荐个这方面的教程，我自己没找到。
谢谢大家！

另外多问个问题，小分子上的某个原子，受到外界各种电子相互作用影响以后，这个原子上电子云的密度可以定量计算吗？
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我很喜欢计算机辅助药物设计
1楼 2015-08-10 10:14:56
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fanc232: 金币+30, ★有帮助, 版主完全地回答了我两个问题，回答又特别及时！引导性很强！ 2015-08-16 09:33:14
HOMO、LUMO是每次计算都会自动输出的内容。加关键词pop=full可以输出详细的MO信息。在GV中可以看到HOMO、LUMO的能级和形象。
原子上电子云的密度可以定量计算出来，电荷的前后变化量也可以定量计算出来。
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2楼2015-08-10 11:22:56
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chu5263821

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fanc232: 金币+20, ★有帮助, 我毕竟还没入量化软件的门儿，所以这位同学的回答对我来说，很详细，帮助很大！ 2015-08-16 09:34:16
在opt优化结果中寻找occ和virt的数值，occ最后一个值就是HOMO，virt第一个值就是LUMO，LUMO-HOMO之差叫能隙差，其值越大，表明分子越稳定，其值越小，表明分子越活泼
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不悔梦归处 只恨太匆匆
3楼2015-08-12 06:41:57
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ztl19780124

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chu5263821 at 2015-08-12 06:41:57
在opt优化结果中寻找occ和virt的数值，occ最后一个值就是HOMO，virt第一个值就是LUMO，LUMO-HOMO之差叫能隙差，其值越大，表明分子越稳定，其值越小，表明分子越活泼

请问这个有没有什么依据？还是实验证明的呢？
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4楼2015-08-12 11:10:17
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xamiracle407

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-08-10 11:22:56
HOMO、LUMO是每次计算都会自动输出的内容。加关键词pop=full可以输出详细的MO信息。在GV中可以看到HOMO、LUMO的能级和形象。
原子上电子云的密度可以定量计算出来，电荷的前后变化量也可以定量计算出来。

您好，请问电荷前后变化量怎么计算
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5楼2015-12-29 23:16:51
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zhou2009

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xamiracle407 at 2015-12-29 23:16:51
您好，请问电荷前后变化量怎么计算...

电荷计算详见:《广义化的电荷分解分析(GCDA)方法》
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6楼2015-12-30 09:39:55
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