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fanc232

新虫 (小有名气)

[求助] 求推荐计算HOMO-LUMO gap的教程 已有2人参与

大家好,我是学生物的,现在研究药物小分子-蛋白质大分子之间相互作用。
查文献说计算HOMO-LUMO之间的gap,可以帮助预测药物分子-蛋白质作用强度。
因此在这里求大家给推荐个这方面的教程,我自己没找到。
谢谢大家!

另外多问个问题,小分子上的某个原子,受到外界各种电子相互作用影响以后,这个原子上电子云的密度可以定量计算吗?
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我很喜欢计算机辅助药物设计
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
fanc232: 金币+30, 有帮助, 版主完全地回答了我两个问题,回答又特别及时!引导性很强! 2015-08-16 09:33:14
HOMO、LUMO是每次计算都会自动输出的内容。加关键词pop=full可以输出详细的MO信息。在GV中可以看到HOMO、LUMO的能级和形象。
原子上电子云的密度可以定量计算出来,电荷的前后变化量也可以定量计算出来。
2楼2015-08-10 11:22:56
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chu5263821

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
fanc232: 金币+20, 有帮助, 我毕竟还没入量化软件的门儿,所以这位同学的回答对我来说,很详细,帮助很大! 2015-08-16 09:34:16
在opt优化结果中寻找occ和virt的数值,occ最后一个值就是HOMO,virt第一个值就是LUMO,LUMO-HOMO之差叫能隙差,其值越大,表明分子越稳定,其值越小,表明分子越活泼
不悔梦归处 只恨太匆匆
3楼2015-08-12 06:41:57
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ztl19780124

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chu5263821 at 2015-08-12 06:41:57
在opt优化结果中寻找occ和virt的数值,occ最后一个值就是HOMO,virt第一个值就是LUMO,LUMO-HOMO之差叫能隙差,其值越大,表明分子越稳定,其值越小,表明分子越活泼

请问这个有没有什么依据?还是实验证明的呢?
4楼2015-08-12 11:10:17
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xamiracle407

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-08-10 11:22:56
HOMO、LUMO是每次计算都会自动输出的内容。加关键词pop=full可以输出详细的MO信息。在GV中可以看到HOMO、LUMO的能级和形象。
原子上电子云的密度可以定量计算出来,电荷的前后变化量也可以定量计算出来。

您好,请问电荷前后变化量怎么计算
5楼2015-12-29 23:16:51
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zhou2009

版主 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xamiracle407 at 2015-12-29 23:16:51
您好,请问电荷前后变化量怎么计算...

电荷计算详见:《广义化的电荷分解分析(GCDA)方法》
6楼2015-12-30 09:39:55
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