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shiling1813

新虫 (小有名气)

[求助] CO2分子的构形不再是直线型的原因? 已有1人参与

大家好。最近我使用forcite进行50个CO2分子动力学计算时,发现有些CO2分子的构形不再是直线型的,键角之间的夹角不再是180度,我现在有些困惑啊,不知道是势函数(我用的是compass势)的问题,还是其它的问题?

       我在进行分子动力学计算之前。先使用Dmol3模块对一个CO2分子进行了结构优化,优化完后CO2分子还是直线型的,然后复制了50个CO2进行分子动力学NVT系综计算,发现有些CO2分子的构形不再是直线型的。

       请前辈高人指点!
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shiling1813: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-08-10 21:09:59
单个CO2是直线型,多个CO2中的单个CO2就不一定是直线型,因为CO2还要受其他原子作用。
对于单个CO2而言,如果其他原子对其有作用力,O-C-O键角改变是很正常的事情。
COMPASS和Dmol3模块,分别是分子力学和量子力学的方法,如果两者分别对单个CO2几何优化后,键角不一致也是很正常的事情。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2015-08-09 18:56:31
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shiling1813

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-08-09 18:56:31
单个CO2是直线型,多个CO2中的单个CO2就不一定是直线型,因为CO2还要受其他原子作用。
对于单个CO2而言,如果其他原子对其有作用力,O-C-O键角改变是很正常的事情。
COMPASS和Dmol3模块,分别是分子力学和量子力学 ...

十分感谢!
我还想问你具体几个问题。
1 其它原子对CO2分子的原子的作用力会强于CO2分子内的原子之间的作用力吗?
2 根据你的经验,在compass模块中,其它原子对CO2分子的原子的作用力可以导致O-C-O键角改变吧?在我的模拟中,O-C-O键角基本在173-180度之间,这个范围是正常的吧?
3楼2015-08-10 21:09:54
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