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长风892

木虫 (著名写手)

[交流] DNA电泳实验请教

请问哪位高手能指点下DNA电泳中该选择什么样的Mark啊?
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
呃~~~你拿什么进去电泳的呢?
另外,电泳图这样看比较诡异……最好是倒过来看啦……
或者你说说你的胶浓度以及电泳的电压、时间
我来猜猜大概是什么长度的~~~

(可怕的smear……)
5楼2008-08-14 23:12:04
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
根据自己DNA选择可比对的Marker
常用
NEB 1Kb :Effective Size Range: 500 bp to 10 kb
(N3232S  200 gel lanes   500 μg/ml  )
Fragment  Size (bp)  Mass (ng)  

1  10,002  42  

2  8,001  42  

3  6,001  50  

4  5,001  42  

5  4,001  33  

6  3,001  125  

7  2,000  48  

8  1,500  36  

9  1,000  42  

10a  517  42  

10b  500  42  


Takara 100bp:
(3407A 100 bp DNA Ladder   500 µl (100 lanes)  )
2楼2008-08-14 22:08:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):楼主还有问题,你再看看。
根据你的片段大小来选择
比如要看DNA的抽提情况,可以选λ HindIII的marker,里头的片段大多为kb级别的
如果想看普通RT-PCR的产物,那么可以选100bp的ladder
如果想比较小片段,可以选择50bp甚至20bp的ladder
还有一个原则,假如你明确知道某个片段的大小,那么就一般不需要用到很“精密”的ladder,否则反而会影响判断
比如你想分开300bp和100bp,那么选择100bp的ladder就比较适合,就别选什么50bp或者20bp的ladder,那样很难看清楚marker内部的条带分离,说不定marker都跑飞了几条(太小容易飞……)
3楼2008-08-14 22:10:51
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长风892

木虫 (著名写手)

以下是我一次实验预试,请问按照图片所示该怎么选择啊?
4楼2008-08-14 23:08:06
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