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wangyx2002木虫 (正式写手)
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[求助]
测序样品处理的问题
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有没有大虾做过果实类感抗病（真菌）基因的？有两个方面需要求助： 1、接种上病原菌后采样点的设定原则？ 2、果实送样部位（是果实发病严重的部位或交接处还是无病征的部位） |
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yingyangyang 
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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wangyx2002: 金币+15, 博学EPI+1, ★有帮助, 谢谢。 2015-09-01 10:26:54
wangyx2002: 金币+15, 博学EPI+1, ★有帮助, 谢谢。 2015-09-01 10:26:54
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寻找抗病基因，应该是感染后选择抗病强的长势好的植株或果实来采样吧。如果是采集受感染严重的植株，一般样品中会混有真菌，如果真菌量很大，你后续测序得到的大部分都是真菌的数据，如果较少如果你的真菌基因信息是已知的可以剔除真菌数据，但是如果真菌基因信息数据未知那就无法区分了。 个人的理解：应该是设置一组易感病植株但是不做感染处理当做对照，一组是抗病植株（这要基于前期的实验筛选得到的植株）。采集两组植株同一部位进行比较寻找抗病基因。 |
2楼2015-08-18 15:34:29