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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

[求助] nve 系综下体系温度急剧增加怎么回事? 已有6人参与

将整个系统置于NVE 系综中之后,又利用Nose-Hoover 热浴来对上下固壁分别进行控温,为什么 体系的温度会急剧增加呢?该怎么解决?在同一个体系中fix nve,
fix nvt 不能同时出现吗?
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我若盛开,蝴蝶自来
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
控温了还能叫NVE系综?

建议重学物理化学
2楼2015-08-05 09:31:08
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普通回帖

对天空说lrj

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fhh2626 at 2015-08-05 09:31:08
控温了还能叫NVE系综?

建议重学物理化学

谢谢您的回答,NVE系综下就不能分别对不同的group控温吗?这也是文献中提到的方法,您可以看一下我上一条求助的主题,相同的问题没有得到解决
我若盛开,蝴蝶自来
3楼2015-08-05 09:40:01
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fhh2626

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 对天空说lrj at 2015-08-05 09:40:01
谢谢您的回答,NVE系综下就不能分别对不同的group控温吗?这也是文献中提到的方法,您可以看一下我上一条求助的主题,相同的问题没有得到解决...

哦,我理解错了

我的意思是只要使用了控温就不能叫NVE系综了,但是具体lammps怎么设置我不了解
4楼2015-08-05 15:18:10
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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fhh2626 at 2015-08-05 15:18:10
哦,我理解错了

我的意思是只要使用了控温就不能叫NVE系综了,但是具体lammps怎么设置我不了解...

哦哦,还是谢谢了,这个问题我困扰太久了
我若盛开,蝴蝶自来
5楼2015-08-05 20:01:20
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spearous

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是和体系密度变化有关?
6楼2015-08-06 18:06:26
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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by spearous at 2015-08-06 18:06:26
是不是和体系密度变化有关?

应该是,因为后来是上下固壁固 定了不同的温度,然后就出现体系温度急剧上升的情况了?但是不知道怎么解决
我若盛开,蝴蝶自来
7楼2015-08-06 18:14:53
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维特的日记

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你设置的时间步长有没有问题呢? 时间步长的设置让体系的能量能够守恒才行,fix nvt是可以只控制某个group的 建议你先在目标温度下进行nvt弛豫,然后转到nve弛豫,最后再施加fix nvt对个别group控温
8楼2015-08-07 22:35:11
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spearous

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我是做生物分子模拟,没用过lammps。不过我猜模拟之前做预平衡的步骤应该类似。
那个文献前50万步是做温度预平衡吧,你可以输出这时候的能量或者温度结果看看是不是达到了预期平衡。另外,检查一下你的压强设定是否合理?
9楼2015-08-08 02:43:15
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tracel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

lammps 不能对同一原子施加多个系综,但可以分group设置多个系综。
10楼2015-09-08 22:15:40
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