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alfred111

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 酵母染色质的提取方法

哪位大虾能告诉俺酵母染色质的提取方法阿?谢谢啦
还有其中用到的磷酸钾缓冲液的浓度是0.5M还是0.05M? PH=7.5
小妹急用阿
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
没有提过,染色质是不是就是所谓的基因组DNA啊?好像有配套的试剂盒可以买到吧。缓冲液来讲一般使用的时候50mM就够了,不过具体情况具体分析要是储存浓度可就说不好了。
金币是赌出来的
2楼2008-08-13 15:02:14
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mark32280667806

★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+4,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
酵母总DNA提取常规NACL方法:
1.        1分钟收集菌体,沉淀悬浮在破菌400微升BUFFER,加入3 0μl 10mg/ml溶菌酶,同时加1微升1mg/ml的RNA酶;
2.        37℃ 孵育1hour;
3.        60度水浴30分钟,不间断,用枪头激烈吹打破碎细胞;
4.        加入200微升5M  NACL,混匀,12000离心10分钟;
5.        取上清,转入到另外的EP管中,加入等体积的氯仿,剧烈摇匀;
6.        12000离心10分钟,将上层水相转入到另一个EP管中;
7.        2v体积无水乙醇沉淀,-20度放置10-20分钟;
8.        12000离心10分钟,弃上清;
9.        70%乙醇洗涤,离心10分钟,烘干,TE溶解。
   
BUFFER:            100ml                  
100mM TRIS-HCL     PH 8.0
5mM  EDTA         PH 8.0
500mM NACL
1.25% SDS
1M  巯基乙醇       16微升


酵母基因组的提取方法(改良):
1.        接种酵母到2.5ml 酵母试管培养基中(YPD 培养基),30℃,培养16~18h;取1.5ml 酵母培养液,室温下,1500 × g 离心5~10min 收集菌体;菌体用灭菌水洗1 次,1500 ×g离心5min;
2.        菌体用200μl SCED(1mol/L 山梨醇、10mmol/L 柠檬酸钠、10mmol/L EDTA、10mmol/L DTT二硫苏糖醇)溶液重悬,加入3 0μl 10mg/ml 溶菌酶(Lysozyme)37℃温浴1h;
3.        加入100μl 2%SDS 混匀,- 20℃冰冻,然后室温震荡溶解,反复3 次;
4.        向悬浮液中加入150μl 5mol/L KAc(pH 8.9)轻轻混匀,然后10000r/min离心5min;
5.        将上清转移到一新的1.5ml 离心管中,加入2 倍体积的乙醇,轻轻混匀,室温放置5min 后12000r/min离心10min;
6.        除去上清,将沉淀溶解在300μl TE(10mmol/LTris-HCl,pH7.4,1mmol/L EDTA,pH8.0) 中,
7.        加入6μl RNase (10mg/ml),37℃温浴30min;加入饱和酚和氯仿各150μl 充分混匀,然后10000r/min 离心5min;
8.        转移上清到新的1.5ml 离心管中,加入1/2体积的7.5mol/L NH4Ac(pH7.5)和等体积的异丙醇,- 20℃放置20min 后12000r/min 离心10min
9.        除去上清,加入300μl 70% 乙醇漂洗沉淀一次,10000r/min 离心5min;
10.        风干除去乙醇,用2 0μl TE 溶解酵母DNA。
3楼2008-08-13 19:35:19
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mark32280667806

还有什么不明白的,可以联系我,QQ:32280667
4楼2008-08-13 19:37:51
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