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jinshengfang

木虫 (正式写手)

[求助] 如何查找大肠杆菌噬菌体的保守序列 已有1人参与

如题
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生物催化
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csyhaoge

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jinshengfang: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-08-13 17:05:27
大肠杆菌噬菌体按是否能裂解噬菌体分为烈性及温和性噬菌体,也可按形态的不同分为T系等,目前仍有新的大肠杆菌噬菌体被发现。大肠杆菌其种类之多,远远的超出想象,楼主只是说想要找大肠杆菌噬菌体的保守序列,这个说的有点太广泛了,那么多种类的噬菌体,真心的不好找。
建设楼主已经知道你的噬菌体是哪一种的话,个人建议,当然了,没猜错的话,楼主找大肠杆菌噬菌体的保守序列无外乎就是想做一个PCR,以此来判断造成污染的噬菌体是哪种么~个人建议,可以在NCBI上找到该噬菌体繁殖的必须基因(还是有不少的),拿这个基因与大肠杆菌其他噬菌体编码相似担保的基因进行比对,同源性不高的话,即可进行后续实验。
以上只是举出一个例子,对于不清楚是哪种的大肠杆菌噬菌体,楼主只能按照上述方法慢慢找寻了~~
2楼2015-08-13 13:39:01
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jinshengfang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by csyhaoge at 2015-08-13 13:39:01
大肠杆菌噬菌体按是否能裂解噬菌体分为烈性及温和性噬菌体,也可按形态的不同分为T系等,目前仍有新的大肠杆菌噬菌体被发现。大肠杆菌其种类之多,远远的超出想象,楼主只是说想要找大肠杆菌噬菌体的保守序列,这个 ...

其实我也不是要验证我的是哪种噬菌体,我是想看看我的菌种是不是已经染温和噬菌体了。因为鉴定不好鉴定嘛
生物催化
3楼2015-08-13 17:11:49
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