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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 什么是“序列轨迹文件”
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)

[交流] 什么是“序列轨迹文件”

原文如下：EST数据中存在许多由测序过程产生的错读碱基，发现错误数据有两种方式，一是通过测序过程中产生的序列轨迹文件（sequence trace file）来发现错误读数的碱基。
这是什么意思啊？
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1楼 2008-08-12 14:42:57
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民
★ ★
sxdxrhyy(金币+2,VIP+0):xiexie
序列轨迹文件（sequence trace file）就是平常说的“波形图”。通过波形图容易辨别误读碱基。
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钱要流动，人要走动
2楼2008-08-12 18:19:42
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
怎么辨别啊？
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3楼2008-08-14 10:47:59
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
看四色荧光波峰高度而定。
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钱要流动，人要走动
4楼2008-08-14 11:52:51
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
还是不太明白，四色荧光峰高度是参差不齐的，怎么判断啊？低的就是错的？
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5楼2008-08-15 14:13:07
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望天石

银虫 (正式写手)
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
看波形和信号强度；反应好的序列波形图，四色荧光错落有致，相互间干扰很少，且强度基本一致。
若是还不懂，不妨将你的图发一部分上来。不过，不好辨认的图，通常是因为反应没有做好造成的。
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极目楚天舒
6楼2008-08-15 14:23:07
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xiaochong0101

铜虫 (小有名气)
那么这个意思是不是说，在四色荧光错落有致，相互间干扰很少的情况下，信号比较弱的那个碱基，有可能是错读的？
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7楼2008-08-19 08:23:08
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望天石

银虫 (正式写手)
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
离开具体的峰图还是不好判断的，一般情况下，信号弱的表示信度不高，但是程度因具体情况而异。
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极目楚天舒
8楼2008-08-22 00:41:54
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
做好测序反应及base calling，需要逐渐积累工作经验的
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
9楼2008-08-23 10:13:31
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