24小时热门版块排行榜    

查看: 896  |  回复: 7

younggood

铜虫 (小有名气)


[求助] irc 已有1人参与

各位大神们,我做了个氢转移的过渡态,跑irc的时候跑了3天了,跑了5000k了,结果才跑出了两个点,以前跑irc时,跑70多个点才2000k左右,它们体系的基函数都是一样的,请问这是怎么回事呢,为什么irc明明这么大了才跑出两个点呢,这么慢,我的输入文件没有问题呀
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
2楼2015-07-25 23:48:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

younggood

铜虫 (小有名气)


有没有大神能给我解答一下呀
3楼2015-07-26 21:15:05
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

younggood

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by younggood at 2015-07-26 21:15:05
有没有大神能给我解答一下呀

我是用服务器算的,用电脑的高斯irc可以跑啊,为什么用服务器就无法算了呢,有什么影响吗,拜托懂得给我解答一下吧
4楼2015-07-27 10:50:40
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xieruobing

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

楼主的过渡态找的对么,虚频什么的,还有就是大体振动模式对么?如果不对就从这方面找原因,如果是对的,那么就看一下输入文件是否有错误。楼主可以贴部分去掉坐标部分的输出文件看看么,我们一般用的是calcfc,因为我们的服务器用calcall很慢,出现楼主那样的情况很正常
5楼2015-07-29 09:49:34
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

younggood

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
5楼: Originally posted by xieruobing at 2015-07-29 09:49:34
楼主的过渡态找的对么,虚频什么的,还有就是大体振动模式对么?如果不对就从这方面找原因,如果是对的,那么就看一下输入文件是否有错误。楼主可以贴部分去掉坐标部分的输出文件看看么,我们一般用的是calcfc,因为 ...

这是输出文件的最后面:
Cartesian Forces:  Max     0.000241173 RMS     0.000035987
IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC
Error in corrector energy =           0.0000000030
Magnitude of corrector gradient =     0.0007997631
Magnitude of analytic gradient =      0.0005746588
Magnitude of difference =             0.0004867722
Angle between gradients (degrees)=   37.1225
Pt 52 Step number  20 out of a maximum of  20
Modified Bulirsch-Stoer Extrapolation Cycles:
    EPS =    0.000010000000000
Maximum DWI energy   std dev =  0.000000158 at pt  1190
Maximum DWI gradient std dev =  2.238659722 at pt   988
WARNING: Bulirsch-Stoer Method is not Converging
CORRECTOR INTEGRATION CONVERGENCE:
   Recorrection delta-x convergence threshold:    0.010000
   Delta-x Convergence NOT Met
Maximum number of corrector steps exceded.
Error termination via Lnk1e in /opt//g09/l123.exe at Wed Jul 29 22:29:22 2015.
Job cpu time:       4 days 12 hours 37 minutes 14.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   5724 Int=      0 D2E=      0 Chk=     56 Scr=      1
我的输入文件是# irc(calcfc,maxpoints=40,stepsize=5) M06/gen pseudo=read
请问有什么好的解决办法吗
6楼2015-07-30 16:35:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

younggood

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by younggood at 2015-07-30 16:35:52
这是输出文件的最后面:
Cartesian Forces:  Max     0.000241173 RMS     0.000035987
IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC
Error in corrector energy =           0 ...

我的过渡态挺对的,振动的模式都对,过渡态应该没有问题
7楼2015-07-30 16:36:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

younggood

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by younggood at 2015-07-30 16:35:52
这是输出文件的最后面:
Cartesian Forces:  Max     0.000241173 RMS     0.000035987
IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC
Error in corrector energy =           0 ...

另外,我跑irc还有一个问题,就是我明明maxpoints设置了40个点,有的时候它总共跑30来个点就自己正常结束了,请问这是什么原因呢,我看跑的irc上的30来个点,只有一个产物的最低点和过渡态的最高点,反应物的那个点都没有跑出来怎么就正常结束了呢,请问能帮我解答一下吗
8楼2015-07-30 16:42:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 younggood 的主题更新
信息提示
请填处理意见