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yf-deng金虫 (正式写手)
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[交流]
请问基因复制的验证及其特征？
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大家好！我在文献（发表在gene上）上看到有根据进化树来判断两个基因是基因复制造成的，不知道这样判断的根据是什么？还有用什么样的实方法来验证基因复制吗？若是基因复制的话用染色体步移的方法来将这两个基因连起来是否可行？还有什么更好的办法来验证吗？ 我现在扩增了两个相似度很高的基因，同源关系非常近，所以我怀疑其中有一个可能是基因复制造成的，所以请问大家研究一个基因是否是由于基因复制造成的用什么方法比较好？最好是简单易行的（我们这里条件有限）？ 还有就是加入两个基因其中有一个基因是基因复制造成的话，请问他们对应的DNA在染色体上位置如何？是复制造成的基因靠下游（3端）？复制基因与源基因（表述可能有问题）之间的距离是紧挨着（见图）？相隔一段距离（如串联一样）？还是有重叠部分？ 最好哪位兄台帮我解释一下基因复制有那些特点？我找了很久没有找到。 |
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xyklmu
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我没有看到你说的这篇文献，不知道他们是如何根据进化树来判断基因复制的。一般我们根据进化树可以判断两个基因之间的相似度，他们的进化距离等。根据他们是否有相似的基因结构比如保守的domain来判断他们是否属于一个基因家族。一般认为基因家族的形成是基因复制或者基因倍增的结果。 染色体步移可以从已有的序列去探索未知的、位于同一条染色体上的dna序列，我不清楚如何按照你的想法将两个基因连起来。一般说，基因复制以后，复制形成的那个基因可能会发生突变而失活或者转座而离开原位置。至于是你说的，在原基因的上游还是下游，很难定论的，开始可能是前后相连的，后来可能会在原地也可能会发生转座而迁移到新的位置。真核生物的基因组内发现了大量的基因或者基因组复制的痕迹，主要是根据同源性来判断的。 楼主感兴趣这方面的东西话，可去pubmed，输入 gene duplication，你会找到很多文献的，或者再限制一下文献的类型，只搜索综述，会快速了解这一领域的进展的。 |
2楼2008-08-10 04:08:36
xyklmu
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3楼2008-08-10 04:11:06