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Rhea_nyx

新虫 (初入文坛)

[交流] 用matlab从基因组(fasta格式)中提取特定序列 已有1人参与

现在有一个fasta格式的基因组序列,怎样从中提取特定位置,比如5000-5500的序列?
【想问一下代码里可以直接打开fa文件就是写成  fid=fopen('*****.fa','r')  这样子吗?
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rainbow3311

铁虫 (小有名气)


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data = fastaread('sequence.fasta');
da2=data.sequence;
first_500_bases = seqdisp(da2(5000:5500));
2楼2020-11-21 17:12:19
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