24小时热门版块排行榜    

查看: 1419  |  回复: 7

kobe_liuxing

铜虫 (小有名气)

[求助] IRC分析出现问题 已有4人参与

本人在做甲醇分子和NO2反应的过渡态的IRC分析,图1为过渡态的结构,跑到22步就报错终止了,最终的结构如图片22。我设置的是往两边计算,但是,得出来结构却只往反应那边计算。最后打开输出文件,也没看到EEROR。(PS:这个过渡态是我自己构想的,根据QTS2方法计算得到的,因为QST2没能完成计算,到中途就报错终止了,所以,我就根据停止位置的构型进行改造,直接想进行IRC来试图确认这个过渡态)。本人非化学出生,也是刚接触量化计算,希望得到大家的帮助。

IRC分析出现问题
1.png


IRC分析出现问题-1
10-IRC.png


IRC分析出现问题-2
22.png


IRC分析出现问题-3
set.png


IRC分析出现问题-4
报错文件.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wy_001049

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
IRC要往两边跑,一遍是forward,一边是reverse,你分别试试
2楼2015-07-23 21:52:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kobe_liuxing

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wy_001049 at 2015-07-23 21:52:00
IRC要往两边跑,一遍是forward,一边是reverse,你分别试试

我试了,结果都像反应物那边。不能完整得到反应物和生成物。
3楼2015-07-24 16:27:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ygq1990

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把步长改小一下试试,或者是把点数增加到100,跑起来应该也不会很慢
just try it
4楼2015-07-24 17:14:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kobe_liuxing

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ygq1990 at 2015-07-24 17:14:52
把步长改小一下试试,或者是把点数增加到100,跑起来应该也不会很慢

好的,我试试。不过,我有个问题是,我研究的分子于上图所示,这个过渡态,完全是自己随便摆放的位置,没有依据,您在这方面有什么建议吗?
5楼2015-07-24 18:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议用TS方法求过渡态,因为你也不能确定你构想的末态是正确的,QST2更容易跑不到那,分别用forward和reverse向前向后跑。

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-07-25 18:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ygq1990

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by kobe_liuxing at 2015-07-24 18:52:46
好的,我试试。不过,我有个问题是,我研究的分子于上图所示,这个过渡态,完全是自己随便摆放的位置,没有依据,您在这方面有什么建议吗?...

没有依据那找起过渡态来有点困难了。还是先去看文献吧,看看别人是怎么弄的,没有相同的分子,找个相近的反应看看
just try it
7楼2015-07-25 21:26:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xieruobing

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

没有出错的话,是否可以加大N的数目重新提交来跑看看,我们一般是设定30这样,IRC跑挺久的,
8楼2015-07-29 10:13:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kobe_liuxing 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 基金啊基金 +3 longfie172 2026-08-20 3/150 2026-08-21 00:04 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
请填处理意见