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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 哪个软件可以从肽链N端添加残基？
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

[求助] 哪个软件可以从肽链N端添加残基？ 已有2人参与

比如某条肽链是GTFT...，有pdb文档，但是实际上前三位残基HAE缺失，请问哪个软件可以在不改变后面GTFT...空间构象的情况下从N端往前添加缺失的三个HAE残基，形成HAEGTFT...的序列?
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Today-will-be-history.
1楼 2015-07-22 09:44:37
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rabit5522

木虫 (著名写手)

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ruoqiu.xiao: 金币+5, ★有帮助 2015-07-23 21:29:32
就我用过的软件里，分子设计软件MOE是可以做到的啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊
凑够15个字
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2楼2015-07-22 14:04:00
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longdlut

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ruoqiu.xiao: 金币+5 2015-07-24 17:07:27
pymol软件就可以
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3楼2015-07-24 11:01:22
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by longdlut at 2015-07-24 11:01:22
pymol软件就可以

是不是得从头构建氨基酸残基？
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Today-will-be-history.
4楼2015-07-24 17:07:22
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

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4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2015-07-24 17:07:22
是不是得从头构建氨基酸残基？...

在原有结构上进行修改就可以，不需要更改原先的二级结构
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5楼2015-07-27 08:50:52
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kejidaxue

铜虫 (正式写手)
您好！我也遇到相同的问题，您是怎样解决的呢？我尝试使用pymol添加，用build-residues在N端添加两个氨基酸，序列上显示所添加的氨基酸和原有序列并不连续，而且添加的两个氨基酸都是2的位置上，不知道这样对不对
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6楼2019-03-27 06:52:07
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kejidaxue

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rabit5522 at 2015-07-22 14:04:00
就我用过的软件里，分子设计软件MOE是可以做到的啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊
凑够15个字

您好！我也遇到相同的问题，您是怎样解决的呢？我尝试使用pymol添加，用build-residues在N端添加两个氨基酸，序列上显示所添加的氨基酸和原有序列并不连续，而且添加的两个氨基酸都是2的位置上，不知道这样对不对
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7楼2019-03-27 06:52:35
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