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wangliually

新虫 (初入文坛)

[求助] NUPACK nucleic acid package的使用方法 已有1人参与

有没有人用过 NUPACK nucleic acid package啊?求详细的使用手册。不是官网上下载的nupack_user_guide_3.0这样的文件。是要详细介绍怎样设计序列,分析序列存在的各种可能性的及比例,编写代码等等的详细介绍。
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asy10001

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wangliually at 2015-07-22 14:55:42
自己帮顶先

如果不是要求计算很细节的东西的话,NUPACK官网http://nupackweb.piercelab.caltech.edu/design/new 应用界面的Demos和Help就足够用了。如果楼主需要计算更加细节的东西的话,建议学习Vienna RNA Package里边的程序或者应用界面,  http://rna.tbi.univie.ac.at/,我也不是很懂,一点点建议~
我只想安静的做一只实验狗
3楼2015-10-31 13:18:51
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查看全部 9 个回答

MY-Donghai

新虫 (初入文坛)

duplex region displayed
a ΔG <= -18 kcal/mole (calculated using the software NUPACK
with parameters corresponding to 60℃ and a  salt concentration


楼主知道这个怎么操作吗?请指导一下
4楼2016-05-27 20:29:50
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darling大玲

银虫 (小有名气)

请问楼主问题现在解决了麽,生物小白一枚,现在在序列设计上卡住,求助求助

发自小木虫Android客户端
5楼2018-03-16 12:19:16
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我不吃了

新虫 (初入文坛)

请问师兄/师姐找到方法了吗?我到这里给卡住了,不会用nupack

发自小木虫Android客户端
6楼2019-09-17 16:02:10
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