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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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EchoXu

木虫 (正式写手)

[交流] 关于细菌DNA的序列

文献上写着 " 5' AGG ATC GAA TAA GAG GTC CTT CAT is identical to bases 4610697–4610674 of the B. anthracis Ames strain."
想请教一下4610697–4610674是什么意思啊?有没有办法知道这条链上更长一些的具体碱基序列?

万分感谢!!!!
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徐徐的。。。
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qgaoamtf

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
EchoXu(金币+10,VIP+0):谢谢指导!
4610697–4610674是指B. anthracis Ames strain基因组中核苷酸的号码,其长度为4610697–4610674+1=24(核苷酸)。
这条链上更长一些的具体碱基序列:
如已知某基因符号或全称,见  http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bfind?B.anthracis
BA5092基因 (membrane protein, putative, degenerate) 范围: 4609142..4611116: http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ban:BA5089
http://www.genome.jp/kegg-bin/sh ... p;START_POS=4470001
以下网站也可用:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Good luck!
2楼2008-08-07 22:41:36
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yuyixst

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
EchoXu(金币+5,VIP+0):谢谢指导!
把序列那到NCBI 上面去比对一下就知道了嘛
3楼2008-08-08 08:57:18
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wyzl2007

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
EchoXu(金币+5,VIP+0):谢谢指导!
其实很简单,就是AGG ATC GAA TAA GAG GTC CTT CAT 这段序列,想知道更长的序列可以参考楼上的回答,B. anthracis 好像已经有全序列
4楼2008-08-08 09:35:49
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EchoXu

木虫 (正式写手)

实在太感谢ls的三位了,我是chemistry的,对这方面不是很懂,多谢指导啊!

金币已发

[ Last edited by EchoXu on 2008-8-8 at 11:55 ]
徐徐的。。。
5楼2008-08-08 11:00:01
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qgaoamtf

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
xyklmu(金币+3,VIP+0):感谢指导,欢迎常来
刚上网,这里,完全互补链(3‘-5’)也属于B. anthracis Ames strain基因组里的,但不直接标出,因为任何公布的基因组里只标5‘-3’的核苷酸,对于3‘-5’链,你可下载DNAMAN等软件将3‘-5’链转换为5‘-3’链, 再用该软件或Control+F功能寻找在相应的基因组具体位置;对于5‘-3’链,简单地用Control+F功能寻找其在相应的基因组具体位置即可。
6楼2008-08-09 16:27:35
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