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mark32280667806

[交流] 求高手帮忙,分析RNA抽提结果

各位高手:
小弟是新手,最近抽酵母RNA,电泳结果总看不到28s 18s ,但是在溴芬兰前面可以看到很亮的带,A260/280=1.88,用他们做RT-PCR,也可以扩出来,但是不敢往下做,RNA是用来做差异杂交的,不知道什么原因,忘各位高手赐教,急!!!!
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tetpes

金虫 (小有名气)

有图没,图片更直观些
2楼2008-08-07 21:25:23
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haiven

捐助贵宾 (著名写手)

★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
mark32280667806(金币+1,VIP+0):哥们 ,谢谢了!!!
mark32280667806(金币+1,VIP+0):哥们 ,谢谢了!!!
A260/280是看不出RNA的质量的,那只是检测纯度的方法之一。按你所说,RNA肯定有降解的。最好把图片贴出来,把你的方法和你认为有问题的地方都讲讲,让大伙给你看看。。这样会更好。
走进你,温暖我,迷失于这个世界!
3楼2008-08-07 22:23:49
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mark32280667806

图附上了,请各位高手帮忙看看,小弟先谢过了!!!
4楼2008-08-08 13:45:52
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
mark32280667806(金币+2,VIP+0): 谢谢!!!
降解了
操作过程中有RNase污染,这个样品不要再用了,重新提吧
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
5楼2008-08-08 14:27:20
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jasco

木虫 (正式写手)


mark32280667806(金币+1,VIP+0):非常感谢!!!
降解很严重啦
6楼2008-08-08 15:53:10
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raindrop8316

金虫 (正式写手)

★ ★
mark32280667806(金币+2,VIP+0):非常感谢!!!
应该是降解了。
RT-PCR对RNA的要求不是很高,但差异杂交要求高质量的RNA,你的这个RNA还是不要用的好,免得浪费时间和你的杂交试剂
书到用时方恨少 钱到月底不够花
7楼2008-08-08 16:04:28
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snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
mark32280667806(金币+2,VIP+0):非常感谢!!!这个图是跑了很长时间的,要是时间短,看到的是很亮的带,似乎没有讲解,但是还是看不到28 18,不知道是什么原因???
从图中看是降解了,酵母细胞壁较厚,应采用液氮研磨或玻璃珠法破壁,应该可以获得很多的RNA.提取时,在研钵里用液氮研5分钟就可以了。祝你好运。

[ Last edited by snzydong on 2008-8-12 at 17:34 ]
8楼2008-08-12 17:20:18
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fruit

木虫 (小有名气)


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
应该是降解,如果是没有降解的样品,在跑完电泳后相当长时间内,一般也不会降解的。应该是你在操作过程中不小心或是你所用的器具处理不当造成的。
另外你的RNA的分子量都比指示剂的分子量还小了,你还说不是降解。
9楼2008-08-12 21:10:25
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xyklmu

至尊木虫 (知名作家)

虫眼看世界


mark32280667806(金币+1,VIP+0):非常感谢,你的答复!!!
你的样品跑得太久了,不好说是不是降解了,你其实可以看到在你的最亮的一团RNA的后面还是有28S和18S的rRNA的。以后跑RNA电泳需要电压低,时间短,最好有甲醛胶。
还有一个问题,你没有提到你的上样量是多少?我怀疑你是上样量太大了,以至于5S的小RNA结合了太多的EB,后面的28和18S的RNA的量其实是不少的,只是出现了EB的缺如,导致你认为降解或者看不到了,EB的涌动方向和RNA是相反的,你可以去EB缓冲液里面浸泡一下,看看是否会增加28和18S RNA的亮度。
我做体外转录的时候,经常会得到大量的转录物,以至于经常看不到转录物后面的模板了,其实模板还是很多的。
位卑未敢忘忧国。
10楼2008-08-13 01:24:04
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