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快乐君子

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 318.9
帖子: 67
在线: 21.7小时
虫号: 3354647

[交流] 利用R对RNA-seq的reads 数据进行统计分析

我现在有一组RNA-seq的 reads count数据，这个实验有11种处理（1个control），每一处理3重复，所以用表格整合总的有33列reads count 数据，
我现在想用R中的DEseq2 package算出log2 fold change，我能否对平行实验的reads count取平均？

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1楼 2015-07-20 17:43:08

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贝叶竹青

木虫 (著名写手)

应助: 11 (小学生)
金币: 1266
帖子: 1053
在线: 186.9小时
虫号: 2672108

呵呵

发自小木虫Android客户端

17楼2016-02-01 01:05:40

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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whd2013

木虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 2362.8
帖子: 747
在线: 142.6小时
虫号: 2434596

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

滥发金币的效果就是一堆表情加祝福了

[ 发自小木虫客户端 ]

14楼2015-07-20 19:52:09

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