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qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 克隆一个基因的时候,着么判断5‘UTR是否全了? 已有1人参与

着么判断一个基因的5’UTR是否全了,通过race克隆得到的序列,已经推测出完整的ORF框了,那么着么判断5-UTR是否全了,发文章的时候看那些基因都是叫全长,着么样的基因才能叫全长呢,是不是只要包含完整的ORF框就可以叫全长了?
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qaz139687

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yxwjimmy at 2015-07-21 17:54:53
我认为全长序列应该包括UTR区。
以前上学时问过老师,老师说根据5'RACE的原理判断,通过5'RACE得到的5’UTR应该就是全部5'UTR序列了;3’端要得到polyA序列。

如果提取的RNA前面降解掉几十BP的碱基呢?有没有什么具体的判断标准,还是只要通过race得到的5’UTR就认为是全部的5'UTR序列,3’端的polyA序列还是很好判断的,而且也不会降解掉。
3楼2015-07-22 19:02:45
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yxwjimmy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我认为全长序列应该包括UTR区。
以前上学时问过老师,老师说根据5'RACE的原理判断,通过5'RACE得到的5’UTR应该就是全部5'UTR序列了;3’端要得到polyA序列。
2楼2015-07-21 17:54:53
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