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qaz139687

新虫 (小有名气)

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[求助] 克隆一个基因的时候，着么判断5‘UTR是否全了？已有1人参与

着么判断一个基因的5’UTR是否全了，通过race克隆得到的序列，已经推测出完整的ORF框了，那么着么判断5-UTR是否全了，发文章的时候看那些基因都是叫全长，着么样的基因才能叫全长呢，是不是只要包含完整的ORF框就可以叫全长了？

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1楼 2015-07-17 14:27:29

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qaz139687

新虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by yxwjimmy at 2015-07-21 17:54:53
我认为全长序列应该包括UTR区。
以前上学时问过老师，老师说根据5'RACE的原理判断，通过5'RACE得到的5’UTR应该就是全部5'UTR序列了；3’端要得到polyA序列。

如果提取的RNA前面降解掉几十BP的碱基呢？有没有什么具体的判断标准，还是只要通过race得到的5’UTR就认为是全部的5'UTR序列，3’端的polyA序列还是很好判断的，而且也不会降解掉。