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绘制反应机理势能面的小工具 已有6人参与
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在使用量子化学计算反应机理的论文中, 经常需要绘制反应的势能面(或称势能剖面图). 我以前也做过从头算方面的工作, 曾经写了一个Fortran小程序用来帮助绘制势能面. 主要思路是给出各个反应物种的能量及相对位置, 然后使用程序生成Origin的数据文件, 将数据文件导入Origin就可以直接绘出势能面了. 现在我基本已经不再做从头算方面的工作了, 所以这个小程序已经很长时间未用了, 一直躺在我电脑的某个文件夹中. 可时不时地, 我还会看到有人请教有了计算结果之后如何画反应的势能面. 网上给出的答案有ChemDraw, Origin甚至PowerPoint. 当然, 如果你有闲情逸致, 用Windows自带的画图软件也是可以做出很漂亮的图的. 但那不是我喜欢的方式. 既然我已经不再画势能面了, 这个小程序放在我这里也就没多大用处了. 所以, 我就花了点时间, 将其改造成了一个网上的在线工具, 你可以在直接在浏览器中编辑控制文件, 然后看到绘制效果. 程序还会给出用于Origin的数据文件, 将其导入Origin就可以使用Origin作图了. 我现在将这个小工具放在这里, 希望能对那些需要绘制势能面的人有所帮助. 网址: http://jerkwin.github.io/2015/07 ... %E5%B7%A5%E5%85%B7/ |
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